由于免疫系统的功能与人类健康密切相关，如炎症，感染，肿瘤，衰老，生殖等，人类绝大多数疾病的发病机理涉及到免疫功能，因此免疫学机理在临床绝大多数的疾病病理中得到充分的研究，基础与临床免疫学文献浩如烟海，已发现机体有数十种细胞和数百种分子参于免疫系统，而且这个数量还在不断发展中，这种情况很易使涉及免疫功能的疾病研究陷入细微而忽略免疫系统的整体状况。例如在慢性肝病中，当行使细胞免疫功能的T细胞亚类比值有所改变，或介导免疫的细胞因子如IL-1、IL-2等数量变化，或免疫球蛋白、补体含量不在正常范围时，顺理就成为临床探讨慢性肝病免疫发病机理的原始资料，推测患者免疫系统出了问题，进而成为行使免疫治疗的重要依据，免疫系统功能紊乱的概念因此顺应而生。

 

免疫系统是生物进化史上最晚出现的一个生理系统，也是最神秘的功能性系统之一，物种发展到脊柱动物才逐渐演化出现独立完整的免疫系统，人类对免疫系统及与免疫系统相关疾病的认识还在不断发展。与其它生理系统一样，虽然参与免疫系统与功能的细胞与分子众多，但综合功能是统一专职的，就是识别与排斥异己分子，这是免疫系统功能立论与立足的基础。当某种因素使免疫系统某一成分发生这样或那样的改变，可能会影响免疫功能的强弱或效率，但免疫系统整体的基本功能必须得到维持，不然机体将会出现一系列与免疫功能相关的严重的生存问题（如爱滋病样的临床表现）。1974年，Jerne根据现代免疫学对抗体分子独特型的认识，在Burnet"克隆选择学说"的基础上提出了著名的免疫网络学说(immune network theory)。该学说认为，任何抗体分子或淋巴细胞的抗原受体上都存在着独特型，它们可被机体内另一些淋巴细胞识别而刺激诱发产生抗独特型。以这种独特型识别为基础在免疫系统内构成"网络"联系，在免疫调节中起重要作用。Jerne的网络学说强调了免疫系统是各个细胞克隆之间相互联系、相互制约所构成的对立统一整体，由于Jerne对免疫学理论研究的贡献，他与另外两位科学家一起分享了1984年的诺贝尔医学和生理学奖。

 

免疫网络学说实质上说明的是免疫系统内部的正付反馈调节系统，适度适时地控制免疫反应，其对外表现仍然是统一的整体，识别与排斥异己分子。如果这个调节系统紊乱，将表现为整个免疫系统功能受损，出现一系列与免疫系统相关的临床表现或疾病。而不是仅在某一个疾病中孤立的表现异常。例如在临床资料中有关慢性乙型肝炎患者某种免疫细胞或免疫分子异常的文献众多，而临床上绝大多数患者并不伴行其它与免疫功能相关的疾病，表明这些患者免疫系统的整体功能表现是正常的。就如一棵大树，我们可能发现树的某一部分或某片叶子有这样或那样的缺陷，但大树整体仍是枝繁叶茂生气昂然，因此慢性乙肝病患者某一免疫细胞或分子局部问题决不意味其免疫系统出现紊乱。

 

正常的免疫反应过程伴随靶细胞溶解或免疫复合物形成，这两者会导致组织的炎症性损害，也就是免疫病理现象；免疫病理的程度取决于机体与致病因子双方搏弈的结果，当免疫反应适时适度，在致病因素被控制的过程中，免疫病理不引起临床上的体征与症状；而当免疫病理过强、过弱或个体比较敏感时，可诱发临床上的病症，两者临床表象不同，本质是一致的，都是免疫系统的正常反应。就如一般发热、咳嗽、腹泻一样，既是疾病的表现，也是机体对致病因素正常的反应。在人们对免疫系统功能认识局限的状况下，有些学者将前者视为免疫系统功能正常，而将后者有疾病想象的归为免疫系统功能异常或紊乱。在这样先入为主的思维指引下，大量的临床研究在免疫系统中寻找发病依据，忽略了因果关系分析和免疫系统的整体表现，报告了众多免疫细胞与分子异常的资料，产生了许多疾病的以免疫系统紊乱为依据的免疫学发病机理学说，从而引伸出随后的免疫调节治疗。

 

免疫系统功能紊乱学说之产生就缺乏确却的理论基础与内涵，至今仍是个模糊的概念，含义不清，英文中没有完全相应的同义词（disorder? dysfunction? Confusion?）。按道理免疫系统功能紊乱是免疫系统自身的问题，将仅对某一种抗原（或微生物）的异常反应归因于免疫系统而忽略抗原（或微生物）的因素是难以理解的。这个学说貌似从Jerne的免疫网络引伸而来，实际上一些疾病的免疫发病机理和图解已经远离了Jerne的免疫网络图（内部反馈系统），描绘的是免疫系统对抗原的反应与效应图，例如乙肝免疫发病机理理论将免疫耐受（免疫保护功能的一种表现）与免疫病理（免疫清除功能的伴随表现）这两种免疫系统正常的功能表现混在一起，视为免疫系统紊乱所造成的，在免疫网络中寻找免疫紊乱的机制。其实HBV慢性感染者除了对病毒表面抗原的特异耐受之外，没有任何确切的证据显示其免疫系统功能异常或紊乱，也至今没有一种有效的免疫药物纠正其“紊乱的”免疫系统。有些“免疫紊乱发病机理图”犹如八挂图，其中还带有不少“？”标记以表明不明确的关系，从中演绎出“创新”的学说，这已经背离了现代医学重实证和构效关系的精华。因此，由于免疫系统功能紊乱的概念过于笼统，很容易被随意用于与免疫病理有关的疾病，成为一种现代医学八卦，这是需要临床医学家重视的，并认真地审视与定义免疫系统功能紊乱的概念。