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病毒RdRP核苷酸添加循环新机制

已有 718 次阅读 2022-12-10 08:34 |个人分类:信息分析|系统分类:科研笔记

     RNA病毒包括多种致病病原,对人类健康构成严重威胁。RNA病毒的基因组复制和转录过程需要自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRP)来主导完成,该过程经历引发(initiation)、延伸(elongation)和终止(termination)阶段,由数以千计的核苷添加循环(nucleotide addition cycle,NAC)组成。该循环的机制不仅是了解RNA病毒本质特征的重要内容,也是发展针对RdRP的抗病毒策略的重要依据。关于病毒RdRP的现有研究表明,每个NAC经历四个步骤:1. 反应底物NTP进入RdRP活性中心;2. RdRP活性中心关闭(active site closure);3. 核苷酸转移(nucleotidyl transfer)反应发生(产物RNA的3’-末端添加一个核苷酸);4. RdRP向下一位模板核苷酸转位(translocation)从而开启下一轮循环。过去十余年间,结构生物学与酶学研究已基本完整勾勒出该NAC的机制,但始终未能准确获得催化反应(步骤3)即将发生时的RdRP结构信息,因此对于哪些氨基酸残基在催化反应中发挥关键作用仍存在争议。https://www.ebiotrade.com/newsf/2022-12/20221210070407193.htm

http://www.pubmedplus.cn/P/SearchQuickResult?wd=42df4811-144a-4acc-bf9d-a11562a071e2

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01.Genome, Viral99 篇100.000%
02.RNA, Viral99 篇100.000%
03.Sequence Analysis, DNA99 篇100.000%
04.Phylogeny91 篇91.919%
05.Open Reading Frames60 篇60.606%
06.Molecular Sequence Data55 篇55.556%
07.RNA Viruses54 篇54.545%
08.Cluster Analysis43 篇43.434%
09.RNA, Double-Stranded35 篇35.354%
10.Viral Proteins35 篇35.354%




https://m.sciencenet.cn/blog-280034-1367320.html

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