woodcorpse的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/woodcorpse

博文

MS:中山大学丁涛,吴忠道-肠道菌群调控血吸虫病传播媒介光滑双脐螺适生性的新机制

已有 787 次阅读 2022-3-10 22:39 |个人分类:读文献|系统分类:科研笔记

image

宏基因组组装的基因组揭示了血吸虫病传播媒介光滑双脐螺的碳水化合物和氮代谢机制

Metagenome-Assembled Genomes Reveal Mechanisms of Carbohydrate and Nitrogen Metabolism of Schistosomiasis-Transmitting Vector Biomphalaria Glabrata

Microbiology Spectrum [IF: 7.17]

DOI:https://doi.org/10.1128/spectrum.01843-21

发表日期:2022-03-07

第一作者: Shuling Du(杜淑玲)1,2,Xi Sun(孙希)2,3,4

通讯作者:Zhongdao Wu(吴忠道)(wuzhd@mail.sysu.edu.cn)2,3,4,Tao Ding(丁涛)(dingt8@mail.sysu.edu.cn)1,2,4

合作作者: Jingxiang Zhang, Datao Lin, Runzhi Chen, Ying Cui, Suoyu Xiang

主要单位:

1,2,3中山大学(Department of Immunology, Zhongshan School of Medicine, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China;Key Laboratory of Tropical Disease Control, Ministry of Education, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China;Department of Immunology, Zhongshan School of Medicine, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China)

4广东省生物病媒防治工程技术研究中心(Provincial Engineering Technology Research Center for Biological Vector Control, Guangzhou, China)

血吸虫病是全球第二大重要的寄生虫病,患病人数仅次于疟疾。由于缺乏有效的疫苗,降低媒介淡水螺的数量仍是控制和消除血吸虫病的有效手段。然而,由于化学灭螺药物的长期使用导致抗药性和环境污染等问题日益突出,迫切需要研发新型、安全有效的替代方法。近年来,一系列的研究提示肠道菌群在宿主的生长发育、营养代谢、免疫防御甚至生理行为等诸多方面扮演重要角色,对肠道菌群的干预也逐渐成为病虫害和虫媒传染病防治的热门靶点。因此,通过研究螺类肠道微生物组寻求阻断螺类传播的疾病的新方法具有巨大的潜在应用价值。然而目前关于肠道微生物如何调控螺类正常生命活动的过程尚不清楚,严重制约了绿色螺类防控技术的发展

2022年3月7日,中山大学中山医学院丁涛、吴忠道团队联合在美国微生物学会(ASM)期刊《Microbiology Spectrum》 (IF: 7.17) 发表了题为“Metagenome-Assembled Genomes Reveal Mechanisms of Carbohydrate and Nitrogen Metabolism of Schistosomiasis-Transmitting Vector Biomphalaria Glabrata”的研究论文。为探究上述问题,研究团队以曼氏血吸虫的中间宿主光滑双脐螺为研究对象,利用宏基因组测序和分箱技术,发现淡水螺体内的肠道菌群不仅含有丰富的参与淀粉、半纤维素和几丁质等多糖降解的酶基因,还能保护宿主免受水生环境硝酸盐的毒害

本研究构建了世界上首个由84个微生物基因组草图组成的光滑双脐螺肠道微生物参考基因集,这一数据库可供研究者深入了解光滑双脐螺肠道菌群的种类丰度和功能图谱。研究者发现,与陆生动物肠道微生物大部分是厚壁菌和拟杆菌不同,光滑双脐螺的肠道优势菌以拟杆菌和变形菌为主。功能分析结果显示,这些细菌主要通过淀粉、半纤维素和几丁质降解利用系统协助宿主消化植物中的复杂多糖。值得注意的是,淡水螺肠道内栖息的细菌具有完整的反硝化通路,可能将水体氨氮毒素转化为无毒害物质。研究者还发现,食物和年龄两个因素都会对光滑双脐螺的肠道菌群结构和碳氮代谢产生显著影响。本研究的重要意义在于加深了人们对淡水螺类肠道微生物重要性的理解,为螺类的基础研究提供新思路,也为研发螺类绿色防控技术奠定了理论基础

图1 光滑双脐螺肠道微生物碳水化合物活性酶种类

image

图2 光滑双脐螺肠道微生物氮代谢分析结果

image

论文的通讯作者是中山大学中山医学院的吴忠道教授和丁涛教授第一作者为中山医学院硕士研究生杜淑玲和孙希副教授。该工作得到了中山大学百人计划项目、国家重点研发计划、广东省重点领域研究计划和高等学校学科创新引智计划的资助和支持。

Reference

Shuling Du, Xi Sun, Jingxiang Zhang, Datao Lin, Runzhi Chen, Ying Cui, Suoyu Xiang, Zhongdao Wu, Tao Ding. Metagenome-Assembled Genomes Reveal Mechanisms of Carbohydrate and Nitrogen Metabolism of Schistosomiasis-Transmitting Vector Biomphalaria Glabrata. Microbiology Spectrum (2022). https://doi.org/10.1128/spectrum.01843-21

猜你喜欢

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”专业讨论群,目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论,获得专业解答,欢迎分享此文至朋友圈,并扫码加主编好友带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍末解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。
image

学习扩增子、宏基因组科研思路和分析实战,关注“宏基因组”
image

点击阅读原文,跳转最新文章目录阅读
https://mp.weixin.qq.com/s/5jQspEvH5_4Xmart22gjMA



https://m.sciencenet.cn/blog-3334560-1328880.html

上一篇:iMeta:哈佛刘洋彧等基于物种组合预测菌群结构的深度学习方法(全文翻译,PPT,中英视频)
下一篇:iMeta:德布鲁因图在微生物组研究中的应用(全文翻译,PPT,视频)

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2022-10-7 01:30

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部