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anaconda虚拟环境的搭建

已有 4693 次阅读 2020-4-10 17:34 |个人分类:linux操作|系统分类:科研笔记|关键词:学者

最近计算问题需要在天河新集群上面搭建anaconda环境(非root)账户(安装phonopy,感觉安装pymatgen也应该是一样的)。具体操作如下:

  1. 加载集群默认的anaconda(我需要python2)所以使用anaconda2:

    module load anaconda2/

  2. 创建私有环境:

    conda create -n phonopy -c conda-forge python=2.7

  3. 进入私有环境:

    source activate phonopy

  4. 安装相应软件包,比如phonopy(pip于2020年之后不再支持经典的python2.7,所以一定要用conda安装):

    conda install -c conda-forge phonopy h5py

  5. 这样就可以正常使用phonopy了,如果不想使用该python环境可以(注意这里用exit会退出):

    conda deactivate


配置好之后,每次重新进入只要完成1,3步即可,可以做到.bashrc里面,不过发现一个问题就是激活了anaconda环境后,matlab的首次启动会变得很慢,猜测和一些java的配置有关。



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