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如何用Image J打开confocal 文件 .ids (Image J使用第三弹)

已有 30394 次阅读 2015-1-9 00:29 |个人分类:活色生香de生物科学|系统分类:科研笔记|关键词:学者

-在NIH网页上下载Image J软件并安装

http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html

-下载插件LOCI Tools bundle 插件名为“loci_tools.jar”

http://www.loci.wisc.edu/ome/formats-download.html

在自己电脑里找到imageJ的 安装地址,一般在program file-Image J 文件夹内,把插件loci_tools.jar复制入Plugins文件夹内,插件就安装好了。



-打开.ids文件 import the .ids image into Image J

plugins → Bio-formats →Bio-formats importer


打开 .ids文件 会出现一个对话框,确定自己的设定如下,然后点击OK

-The following settings should be checked:

View Stack with: Standard ImageJ

Stack order: default

Dataset organization : Group files with similar names

Color Options: Custom colorize channels

Metadata viewing: Display metadata results in window

Split into separate windows: Split channels

-Click OK.



这样就可以打开confocal文件了.

这篇方法我是完全翻译参考资料的,但是他是苹果电脑的界面,我的是microsoft的电脑,所以我的示意图对于使用microsoft电脑的小伙伴们比较亲切。

参考文献:

http://confocal.bwh.harvard.edu/Documents/imageJImport.pdf



https://m.sciencenet.cn/blog-5525-857648.html

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