ChIP-seq实验产生了大量数据集，提出了重大的存储和维护挑战。为了解决这个问题，提出了一种专门为ChIP-seq Wig数据设计的无损和有损压缩框架，叫做ChIPWig。

ChIPWig能够随机访问，概括统计查询，它基于为不均匀量化器而设计的最佳点密度非对称理论。

在由ENCODE协会产生的10套ChIP-seq数据集上测试了ChIPWig压缩器。平均来说，无损ChIPWig减小原始文件大小到仅仅6%，并且提供了比bigWig高6倍的压缩率改善。有损特征比无损模式进一步减少文件大小2倍，对于使用专门的NarrowPeaks方法进行峰识别和motif发现几乎没有影响。使用通用计算机，压缩和解压速率大约为0.2 MB/秒。

简单用法：wig2chipwig in.wig out.chipwig

下载：https://github.com/vidarmehr/ChIPWig-v2
语言：C++
时间：20171026
参考：ChIPWig: A Random Access-Enabling Lossless and Lossy Compression Method for ChIP-seq Data


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