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方法分享 | 基于MaxEnt和ArcGIS预测物种分布

已有 551 次阅读 2024-5-22 15:50 |个人分类:GIS,地学,|系统分类:论文交流

 基于MaxEnt和ArcGIS预测物种分布

一、引言

MaxEnt模型,其全称为最大熵模型(Maximum Entropy Model)是一种常用于生物多样性研究中的模型,其基本思想是根据已知的约束条件,推断出概率分布函数,使其熵最大。在生物种群方面,MaxEnt模型可以用来预测物种分布和生境分布,尤其是在缺乏数据的情况下,可以通过利用物种和生境之间的已知约束条件,推断出物种的概率分布。此外,MaxEnt模型还可以用于评估物种对不同环境变化的响应能力,为生物保护和生态系统管理提供决策支持。

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二、方法原理

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编辑三、软件操作

下载MaxEnt软件与示例数据(Tutorial data):

(https://biodiversityinformatics.amnh.org/open_source/maxent/)

软件运行需java环境。在 Samples 和 Environmental layers 选项中加载示例数据的csv和图层文件,并设置输出目录。示例数据为Bradypus variegatus,为中美洲及南美洲的一种三趾树懒,此处讨论各种环境条件对其分布的影响。

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点击 Settings ,将随机测试集比例设置为25或其他数值,点击 Run 运行。

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结果将显示在导出目录中,打开 bradypus_variegatus.html 文件,图像使用颜色来表示适生条件的预测概率,红色表示适合该物种条件的概率很高,绿色表示发现该物种的典型条件,浅蓝色表示适合条件的预测概率较低。

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适生条件概率分布图

表格显示,pre6190_l7(7月平均降雨量)、pre6190_l10(10月平均降雨量)和h_dem(海拔)是贡献度最大的变量,累计贡献百分比达73.2%。

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变量贡献分析

四、ArcGIS可视化

将导出目录的 bradypus_variegatus.asc 文件载入ArcGIS,点击工具箱中的 空间分析工具 → 重分类 → 重分类 ,即可对适生指数分布进行重新分类。

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重新生成的类别将产生为新的图数据。

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对数据进行添加图例、经纬度网格、比例尺等操作,即可生成适生指数分布图,预测适生区域。

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参考格式:Steven J. Phillips. 2017. A Brief Tutorial on Maxent. Available from url: http://biodiversityinformatics.amnh.org/open_source/maxent/. Accessed on 2023-2-17.

*信息来源:海洋科学与管理公众号

 互助教程V:623145513



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