R语言中系统发育树方向的设置、更改

熊荣川

xiong rongchuan

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

通常的系统发育树方向是朝右的，即根在左，末梢在右。在R语言中可以进行方向的修改。

library(ape)

tr <- read.tree(text ="((a:1,b:1):1,(c:1,d:1):1);") #直接在屏幕上输入树文件

plot(tr, direction ="rightwards")  #朝右，这也是默认的方向

plot(tr, direction = "leftwards")  #朝左

plot(tr, direction = "upwards")  #朝上

plot(tr, direction = "downwards")  #朝下

就这么简单，祝您科研愉快！