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R语言从genbank注释文件中提取线粒体基因组非编码基因信息

已有 6635 次阅读 2014-3-11 16:47 |个人分类:我的研究|系统分类:科研笔记|关键词:学者| R语言, 提取, genbank, 线粒体基因组, 注释文件

R语言从genbank注释文件中提取线粒体基因组非编码基因信息

 

#作者信息

熊荣川

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

 

# 预装函数

#发表超过24小时,源代码不再公布。


 

#使用方法

#下载EF196679.gb保存于文件夹“genbank注释文件存放处

#下载EF196679.fasGenbank中的全序,需处理为单行),保存与文件夹“genbank下载的全序文件存放处

#执行下面的命令

Mito.edit("EF196679")

#到文件夹“R语言提取线粒体基因组各基因序列”中查看结果“EF196679tRNAinfo.csv



 




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