基因变异是研究基因功能基本材料和着入点。研究一个基因功能如果能把该基因所有的变异形式都展示出来，可能是件让人比较愉快的事。所以我就写了一个小脚本来实现这个功能。get_gene_poly_fingure.pl。这

个脚本可以产生一张表，如gene_poly_in_irgspv4，和一幅图

       运行的时侯，只需要修改一下脚本中的基因名和染色体部分就行了。当然这个只是个初级产品，图是太难看了，还得继续修改。没辄有的东西我还没整明白，我这是现学现用。如果有朋友需要查询哪个基因的SNP，愿意帮忙。只需要提供基因号就行了（Os开头的，而不是LOC）。SNP的来源为：这篇文章

A map of rice genome variation reveals the origin of cultivated riceA map of rice genome variation reveals.pdf。这个叫水稻第三代单倍型图谱。这个图包含1529份水稻材料的7,970,357个SNP位点。

      最近还有3000多个水稻基因组进行了重测序，没有给出具体的SNP信息，但可以下载测序数据。这东西我还真玩不转，能给一个类似上篇文章那样的东西我都还可以玩下。现在只能等了。