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vasp+ifc2015 debug其二
董校 2022-3-16 00:33
vasp6.3使用了部分fortran08以上写法,导致ifc2015版本不支持的问题。之前用ifc2018编译过了,不过天河上的ifc2018动么动就抽风,报daplfabic错误(原因似乎是某些节点上的dapl版本太老,不同节点上的文件版本竟然不一致,也不知道怎么配出来的)。于是今天晚上心一横,索性强行改一下vasp的源代码,看看能不 ...
个人分类: linux操作|1393 次阅读|没有评论
vasp的编译问题
董校 2022-1-28 17:12
之前在忙编译vasp6,在使用了一段时间之后又发现了另外的一些问题,具体表现为在特定的cpu上面会出现 severe (168): Program Exception - illegal instruction报错。 查了好久,终于找到解决办法,就是在编译的时候添加 -msse3选项,即在makefile.include里面添加: FC = mpii ...
个人分类: linux操作|3143 次阅读|没有评论
vasp 6.3 + ifc2016 编译的问题
董校 2022-1-25 00:49
相对于过去的版本来说,vasp6.3改动了一些代码,里面用了一些fortran2008标准以上的写法,导致和比较古老的intel编译器(intel17.0-2016.11之前的版本,具体参见 https://community.intel.com/t5/Intel-Fortran-Compiler/bug-error-8259-TBP-def-must-contain-1-binding/td-p/1047332)不兼容,主要问题出现在random.F文件 ...
个人分类: 计算相关|3931 次阅读|没有评论
地球上水的起源有了新的思路 ——核幔分离过程中地球深处可以存在巨大的水库
热度 1 董校 2022-1-22 00:23
“地球的水从何而来”是一个由来已久的谜,这对于理解生命是如何出现的以及地球内部动力学是如何随时间演化的至关重要。目前,关于这个问题有两个争议的观点: 1. “地狱起源说”:水来自于地球深处,即地球在吸积期获得了大量的水,并储藏与地球内部; 2. “天堂起源说”:在地球形成后,富水陨石轰炸提供了大 ...
个人分类: 高压化学|2511 次阅读|1 个评论 热度 1
qe计算心得
董校 2020-5-7 13:49
最近一直在折腾qe的事情,总结几点经验: 1.phonopy的超胞法和位移法在胞不是足够大的时候,可能有一些电荷密度波的贡献算不出来。所以最好有时间用qe折腾一遍,尤其是一些比较零碎的组分和低对称性结构。 2.qe有时候会出现gamma点处的声学波虚频,有的还比较大(1THz)同时会连带着周围的q点也有一点虚频 ...
个人分类: 计算相关|6435 次阅读|没有评论
anaconda虚拟环境的搭建
董校 2020-4-10 17:34
最近计算问题需要在天河新集群上面搭建anaconda环境(非root)账户(安装phonopy,感觉安装pymatgen也应该是一样的)。具体操作如下: 加载集群默认的anaconda(我需要python2)所以使用anaconda2: module load anaconda2/ 创建私有环境: conda create -n phonopy -c conda-forge python=2.7 进入私有环境: ...
个人分类: linux操作|4665 次阅读|没有评论
EPW的计算
董校 2020-3-17 23:20
上面是2020年2月份的博客备份: 最近一直在调试EPW和wannier90的东西。结果发现了一个非常奇怪的问题: epw在初始化wannier函数的时候会莫名其妙的卡住,多次更改参数发现无效。更有意思的是小体系不卡,大体系卡。 经过了大量的断点输出和调试,最终结果发现是在fortran的一个神奇bug里面 wannier90的io.f90文件里面 ...
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vasp+wannier2.0
董校 2017-10-16 13:29
现有版本vasp只支持wannier1.2,但实际上vasp是可以和wannier2.0兼容的 具体操作如下: The problem seems to be due to the new version of wannier90-2.0.0 (compiled with the current Intel compiler) The variables list of wannier_setup (src/wannier_lib.F90) has two additions compared to wannier90-1.2: ...
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高压下的Na2He化合物——记我的nature chemistry
热度 12 董校 2017-2-15 11:04
元素周期表上第二个元素 He 是一个非常神奇的元素。它是宇宙中含量第二多的元素,是六种稀有气体元素之一。 He 拥有所有元素中最大的电离能,这意味着 He 是所有元素里面最难以给电子的。同时 He 的亲和能几乎观测不到,这就意味着 He 也难以得到电子。迄今为止,六种稀有气体元素中,氩、氪、氙、氡都有已被确认的化 ...
个人分类: 高压化学|23570 次阅读|17 个评论 热度 12

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