vesperlight的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/vesperlight

博文

按标题搜索
使用Aspera批量下载GeneBank和EMBL数据库数据
2021-1-21 21:13
如果想下载GeneBank和EMBL的数据有很多种方法,对于小量的数据我们可以用ftp下载工具或wget等工具直接下载,对于大的数据为了保证数据下载的速度和稳定性,建议最好使用Aspera进行下载。 Aspera成立于2004年,2013年被IBM收购。Aspera软件对于大数据的传递有很好的支持,在包括生命科学领域内的数 ...
个人分类: linux|6278 次阅读|没有评论
基于crontab的进程守护方法
2021-1-20 22:07
用aspera批量下载几个T的基因组数据的时候,由于网络问题经常会使得apsera超时中止。如果不超时时间设置太长又怕无限期卡死了,这两种情况如果没有及时发现事情又要耽误很久。好在aspera支持断点续传,所以在只需要实时监测aspera的运行情况,如果进程停了就重新开始。我的思路是写一个shell脚本用ps命令检测apsera的任务a ...
个人分类: linux|2565 次阅读|没有评论
Docker中的linux系统添加中文支持
2020-12-18 12:53
新 pull 的 ubuntu等linux系统 镜像如果不支持中文字符 ,会导致路径下的所有中文内容不能正常显示,所以需要配置中文字符集支持。其实这个方法对于直接安装的linux系统也是一样的道理。 1、首先查看查看当前系统中支持的字符集 创建一个 docker 容器 docker run -it ubuntu /bin/bash #不要加--rm ...
个人分类: linux|3991 次阅读|没有评论
无法将grub-efi-amd64-signed软件包安装到/target中的问题解决
2018-1-16 21:05
UEFI引导模式的ubuntu安装时报错“无法将grub-efi-amd64-signed软件包安装到/target中“的问题是一个bug。解决方式很简单,在安装时联网,勾选“安装时下载更新“即可。
个人分类: linux|22729 次阅读|没有评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-22 00:56

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部