博文

寻找启动子的工具

2011-9-5 20:08

一、数据库 UCSC: http://genome.ucsc.edu/ EPD: http://www.epd.isb-sib.ch/ TFD: http://www.ifti.org/ TRRD: http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/trrd TransFac: http://www.gene-regulation.com/ Jas ...

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mRNA序列、cDNA序列、ORF序列、CDS序列、Promoter、STS、ETS

热度 3 2011-9-4 21:46

mRNA （ messenger RNA ）信使 RNA ，是由编码区（ CDS ）、上游的 5’ 非编码区和下游 3’ 非编码区组成，真核生物 mRNA 的 5’ 端带有 7- 甲基鸟苷 - 三磷酸帽子结构， 3’ 端有多腺苷酸尾巴，但 NCBI 中 mRNA 序列实际上是 cDNA 序列 ，即经过反转录得到的与 RN ...

个人分类: 分子生物学知识|65657 次阅读|7 个评论 热度 3

perl提取序列信息写入Excel表

2011-8-30 21:22

perl一个强大的地方，就是有很多别人写好的模块，可以直接搬过来用，就好像提供了很多现在的工具，找到合适的工具就能解决相应的问题，这里用了一个很强大的专门操作Excel的模块Win32::OLE，可以方便的用perl读写Excel数据，用perl提取genebank格式的序列文件中mRNA信息，然后将筛选结果输出到Excel中， ...

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perl批量提取genebank序列文件中编码区、CDS长度、氨基酸等信息

2011-8-29 21:39

我们知道在mRNA的genebank格式的序列文件中包括了非常多的信息，怎样在里面提取想要的信息呢，现在有一个sequence.gb文件，里面包括了二千条拟南芥mRNA的序列信息，现要提取每条mRNA的accession、mRNA长度、description、gene_name、Gene_id、locus_tag、CDS长度、CDS序列、protein_id、product、 ...

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梦过时迁

热度 1 2010-3-14 23:01

小学时，对自然科学感兴趣，立志当一个科学家；初中时，对看书感兴趣，希望能成为一个作家；高中时，对乐器感兴趣，想自己可以成为一个演奏家；大学时，对电脑感兴趣，以为可以成为一个电脑专家；研究生时，对什么都谈不上喜欢与不喜欢，只觉得能好好活着就不容易。

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看农民工如何练成多语种翻译的？

2009-10-23 21:27

看农民工如何练成多语种翻译的？ ------- 农民工朱立军成功的故事 2009 年 4 月 15 日，阿努图瓦总统马塔思凯莱访问加拿大 ...

个人分类: 生活点滴|6603 次阅读|1 个评论

读书的艺术

2009-10-9 08:15

读书的艺术 林语堂 读书或书籍的享受素来被视为有修养的生活上的一种雅事，而在一些不大有机会享受这 种权利的人们看来，这是一种值得尊重和妒忌的事。当我们把一个不读书者和一个读书者的 生活上的差异比较一下，这一点便很容易明白。那个没有养成读书习惯的人，以时间和空间 而言，是受着他眼前的世 ...

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