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R语言入门幻灯片
热度 3 张金龙 2010-3-24 20:38
R语言入门 R语言在自然科学和社会科学的统计和绘图领域正发挥着越来越重要的作用，但由于其需要输入命令，让很多读者望而生畏，其实R语言本身并没有看起来复杂，只要想清楚自己究竟要做什么，你会发现，用R实现十分简洁而清晰。 R ...
个人分类: 科研笔记|15810 次阅读|6 个评论 热度 3
进化时间的估算:r8s软件使用指南
热度 2 张金龙 2010-3-24 20:15
本文所附PDF文件中在Windows编译r8s部分已经过时，请参考博文： 《 怎样在Windows10系统中编译和运行r8s 》 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-1144730.html r8s是美国加利福尼亚大学戴维斯分校的进化生物学家Mike Sanderson编写的用于估算进化树分化时间的软件，在进化生物学、分子生物地理 ...
个人分类: 科研笔记|18211 次阅读|3 个评论 热度 2
天文计算PyEphem指南
张金龙 2010-1-17 00:09
PyEphem (http://rhodesmill.org/pyephem/tutorial.html) ( github , Pypi )是Python下的一个软件包，计算准确度很高，可用来计算不同坐标系下太阳、月亮、行星、彗星及人造卫星的位置，亮度，出没时刻，中天时刻等，为天文爱好者制作星历表提供了很大方便。初次接触该软件可能觉得无从下手，本文做简要介绍。 1. ...
个人分类: 特别转载|13217 次阅读|没有评论
在Ubuntu Linux中安装R
热度 2 张金龙 2010-1-4 01:14
在Ubuntu Linux里安装R软件 1 在终端输入 sudo gedit /etc/apt/sources.list file打开软件源文件 将 deb http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/bin/linux/ubuntu karmic/ 拷贝到该文件中。 2 输入 sudo apt-get update sudo apt-get install r-base 即可安装R基础包 3 在终端键入R，进入R，键入ins ...
个人分类: 特别转载|11545 次阅读|4 个评论 热度 2
在Ubuntu Linux编译r8s
张金龙 2010-1-4 00:20
张金龙 2010年1月4日 2016年10月17日修订 r8s是校对分子钟的著名软件，在分子进化领域有着广泛的应用，但是作者提供的可执行文件只有Mac版本，以及该程序的源代码，用户可在linux下对其源代码进行编译。下面介绍如何在Ubuntu Linux系统下编译r8s的源代码。 1 将r8s压缩包下载到本地，如存放在 “下载” ...
个人分类: 未分类|8988 次阅读|没有评论
统计结果的保存：Sweave in R
张金龙 2009-8-6 22:50
Sweave in R? Sweave是R中的一个函数，用来生成统计报告的。如果你希望将R的代码和LaTeX的代码整合到一个文件中，可以用Sweave函数生成.tex文件，利用安装好的LaTeX编译TeX文件就能生成包含相应计算结果的pdf文件。 Sweave处理的是.Snw文件，其格式几乎与.TeX文 件相同，不同的是，其中的R代码包含在= 和 @ ...
个人分类: 统计分析|12568 次阅读|没有评论
在windows中创建R程序包简明指南（2016年8月15日修订）
热度 4 张金龙 2009-8-5 16:18
在 Windows 下创建 R 程序包简明指南 （ 2016 年 8 月 15 日修订） 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com R 软件中 CRAN 镜像已经有 8957 个程序包在线发表（截至 2016 年 8 月 15 日），几乎涉及统计编程的所有领域。 CRAN 上每个程序包都包含源代码以及编译好的 Windo ...
个人分类: 科研笔记|23290 次阅读|16 个评论 热度 4
生物多样性与宏生态学链接(2016年9月5日)
张金龙 2009-8-5 14:18
链接已经转移到github保存，请参考 https://github.com/helixcn/EcoEvoLinks
个人分类: 特别转载|9301 次阅读|没有评论
R语言：常用统计检验-续
热度 1 张金龙 2009-6-25 13:04
# 理论分布依赖于若干未知参数时 # Kolmogorov-Smirnov 检验 # ks.test() 例一 对一台设备进行寿命检验，记录十次无故障操作时间，并按从小到大的次序排列如下， # 用 ks 检验方法检验此设备无故障工作时间是否符合 rambda=1/1500 的指数分布 # ...
个人分类: 统计分析|17167 次阅读|没有评论 热度 1
R语言：常用统计检验方法
热度 1 张金龙 2009-6-25 00:36
R语言：常用统计检验方法一 写在前面 R已经成为当前国际学术界最流行的统计和绘图软件之一，该语言较为简单易学，统计分析功能强大，且具有很强的绘图功能，能够绘制学术出版要求的多种图表.R语言在生物信息学，进化生物学、生态学与环境、经济学、语言学等领域有着极为广泛的应用。 R软件是跨 ...
个人分类: 生活点滴|30499 次阅读|没有评论 热度 1
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