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用herblabel程序包打印不同风格的植物标本标签
张金龙 2016-11-15 21:12
关于herblabel程序包的介绍, 请参考 http://www.biodiversity-science.net/CN/abstract/abstract10290.shtml herblabel程序包输出不同的标签样式, 目前支持四种 KUN, PE, KFBG以及HU, 效果如下 herblabel程序包的安装 install.packages(herblabel, repos=http://R-Forge.R-project.org) ...
个人分类: 软件介绍|5570 次阅读|没有评论
Rmarkdown与R的动态统计报告 (2019-02-19)
张金龙 2016-9-21 14:49
R的Sweave函数是用来生成动态统计报告的函数:如果将R代码包括在统计结果的Latex源代码中,用Sweave处理后, 就可以生成包含相应代码以及统计结果的统计报告, 十分方便。不过Latex的各种标记比较零碎,除非经常使用,否则各种标记很容易忘记。此外用Sweave通过Latex源代码编译非英文的文档极容易出错, 又很难解决, 同时 ...
个人分类: 软件介绍|6188 次阅读|没有评论
生态学和进化的重要链接EcoEvoLinks
热度 1 张金龙 2016-6-7 00:44
网址 https://github.com/helixcn/EcoEvoLinks Journals Research Groups/Network Macroecology and Biogeography Biodiversity and Global Change Lab Phylogenetic Comparative Methods ans Evolutionary Ecology Biodiversity and the determinants Theoretical Ecology Funct ...
个人分类: 科研笔记|4039 次阅读|1 个评论 热度 1
R系统发育比较分析快速参考V1.0.1
热度 2 张金龙 2016-5-30 01:03
R语言系统发育比较分析快速参考V1.0.1 R_phylogenetics_Reference.zip Latex 源代码和PDF最新版本参见 https://github.com/helixcn/R_phylo_refcard
个人分类: 科研笔记|6071 次阅读|6 个评论 热度 2
在R中绘制进化树:ggtree学习笔记
热度 1 张金龙 2016-4-10 23:21
在R中绘制进化树:ggtree学习笔记 ggtree (https://guangchuangyu.github.io/software/ggtree/)是香港大学余光创博士编写的R程序包。ggtree是ggplot2程序包的扩展 (http://www.ggplot2-exts.org/),能够像ggplot2一样,用图层化的语法绘制进化树。这与APE用参数控制绘图明显不同。与ggplot2一样,在ggtree中,通过不 ...
个人分类: 科研笔记|44996 次阅读|1 个评论 热度 1
ggplot2绘图学习笔记: 数据,图层与统计变换
热度 1 张金龙 2016-4-10 22:54
以下内容的更新的版本已经发布,请参考 http://blog.sciencenet.cn/blog-255662-1169978.html 主要参考 https://www.rstudio.com/wp-content/uploads/2015/03/ggplot2-cheatsheet.pdf ggplot2是R软件高级绘图程序包之一, 正受到越来越多人的欢迎。 但是ggplot2的语法与R绘图的参数有根 ...
13321 次阅读|3 个评论 热度 1
克里格空间插值Kriging及其在R的实现
热度 2 张金龙 2016-3-23 01:09
克里格是一种空间插值的方法. 克里格插值, 是法国地统计学家 Georges Matheron ( 1930 - 2000 ) 基于南非工程师 Danie G. Krige ( 1919 - 2013 ) 的硕士论文发展起来的方法. D. Krige 硕士论文研究的问题是如何根据金矿探测点的含金量推断含金量在空间上的变化. 所谓空间插值, 就是通过一些列具 ...
个人分类: 科研笔记|23254 次阅读|4 个评论 热度 2
R编程的一些规则与建议
热度 4 张金龙 2016-2-1 00:49
R编程的一些规则与建议 使用R软件进行统计分析, 必须要接触R脚本. R脚本是保存了R代码的文本文件, 一般以.R为扩展名. 要高效得进行代码的编写和调试, 需要一个好的编辑器或者好的编程环境. 当然, 每个人都可以使用最简单的文本编辑, 如Windows Notepad 或者Rgui所提供的文本编辑工具, 但是要避免使用MS word等文档编辑 ...
个人分类: 统计分析|7498 次阅读|4 个评论 热度 4

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