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通过重命名的照片整理植物名录
张金龙 2014-3-31 17:39
通过重命名的照片整理植物名录 jinlongzhang01@gmail.com 在生物多样性调查中, 数码照片是快速记录物种信息的手段之一。 调查人员如果对一个地点的植物已经足够熟悉, 无需将所有植物踏查结果写到记录本上, 而是对见到的每种植物拍照, 可回到办公室再进行鉴定和整理。 这样既提高了野外工作的效率, 也提高了鉴 ...
个人分类: 科研笔记|3521 次阅读|没有评论
三维图中的颜色渲染
张金龙 2013-12-30 22:31
三维图中的颜色渲染 Jinlong Zhang jinlongzhang01@gmail.com 在R中绘制三维图常用 persp , 但是 persp 函数并未提供颜色渲染的相应参数。这里提供了一种方法,在 persp 中, 按照取值不同, 添加相应的颜色。 ### 给出x,y以及f取值序列, 要绘制的是f的函数面 x - seq (- ...
个人分类: 科研笔记|5539 次阅读|没有评论
用DIVA-GIS提取温度降水等气候信息
热度 13 张金龙 2013-4-11 10:37
用DIVA-GIS提取温度降水等气候信息 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com 生物地理学研究和生态学研究中, 经常需要知道某地的温度降水高程等信息。 例如, 要探讨物种的生态位宽度, 物种丰富度随温度, 降水以及最低温, 最高温的关系等。 事实上,世界范围内的温度, 降水, 等温性等信息, 已经可以通过互联网免 ...
个人分类: 科研笔记|22213 次阅读|25 个评论 热度 13
瑞典纪事: 实验记录DNA提取/PCR/毛细管电泳
张金龙 2013-2-7 22:30
以下是在瑞典的实验记录, 之前, 操作都是靠口授心传, 加上自己操作. 我将这些步骤详细记录下来. 共分为: DNA提取(离心柱法), 浓度测定, DNA提取的电泳检验, PCR, PCR产物的凝胶电泳检验,毛细管电泳, 96孔板进行DNA提取以及检验等. 全部内容, 均根据自己所做实验整理而成. 实验一 用试剂盒提取植物的全DNA 目的 ...
个人分类: 科研笔记|7166 次阅读|没有评论
两棵进化树一致性的校对
张金龙 2012-12-5 22:58
两棵进化树一致性的校对
两棵进化树一致性的校对 首先, 要保证获得的进化树是有根树, 设定好外类群,并且,分支出现的次序经过排序reorder,这可以在Figtree软件中, 对newick格式的进化树进行操作, export as currently displayed 即可。 其次, 用R软件ape程序包的 cophyloplot函数, 可以实现, 将两棵进化树面对面绘制, 并将名称相同的分 ...
个人分类: 科研笔记|8929 次阅读|没有评论
论文投稿用什么软件修改图片?(生态学)
热度 1 张金龙 2012-7-8 19:51
论文投稿用什么软件修改图片? 张金龙 jinlongzhang01@gmail.com 学术期刊要求在投稿时, 一般要求矢量图(eps, pdf, svg等)或者高分辨率(600DPI以上)的栅格图(一般为TIFF)。 这里简要总结如下: 1 生成图片 绘制用散点图、柱状图、 折线图等,一般用R (免费)、GNUplot (免费)、Python(免费)、Matlab (需购买) ...
个人分类: 科研笔记|12718 次阅读|2 个评论 热度 1
花粉传播有关的几个公式
张金龙 2012-6-23 06:40
$d_{j,k}=\sqrt{(x_{j}-x_{k})^2 +(y_{j}-y_{k})^2}$ $f(x, y; \delta, b)=\frac{ b\Gamma(3/b)}{2\pi\delta^2\Gamma(2/b)^3}e^{(\frac{\Gamma(3/b)d}{\Gamma(2/b)\delta})^2}$ $\pi_{r, jk}=\frac{F_{r,k}f(d_{jk}; \delta, b))}{\sum_{l:fathers}F_{r,l}f(d_{jl};\delta,b)}$ $L(g|alpha_{COV}, delta, b, ...
个人分类: 科研笔记|3256 次阅读|没有评论
Putty退出后保持背景程序运行
热度 2 张金龙 2012-6-14 10:33
Putty退出后保持背景程序运行 Putty远程登录Linux,在putty会话窗口关闭后, 远程的命令也停止了执行, 如果想要命令继续执行, 则需要用screen程序。 方法如下: (1)用Putty登录服务器;用户名,密码 (2)输入screen, 给出帮助提示, 按空格跳过 (3)此时, 程序又回到命令提示符, 但是操作都将在screen中记录。 运 ...
个人分类: 科研笔记|19751 次阅读|4 个评论 热度 2
生态学主要刊物的RSS源 (20170509)
热度 1 张金龙 2012-6-8 05:52
生态学主要刊物的RSS源 (20170509)
RSS xml源文件 journals.opml 该文件为RSS源通用opml格式,可以导入Opera,也可以导入其他RSS浏览器如 Sharp reader ( http://sharpreader.net/ ), RSSOwl (http://www.rssowl.org/ )等 。 当有新文章上线时, RSS浏览器会提示。 包括的刊物有: RSS
个人分类: 科研笔记|5054 次阅读|2 个评论 热度 1

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