不完全双列杂交NCⅡ设计的数据处理方法

在育种过程中，经常需要通过试验设计评价种质资源的遗传特性,培育和引进自交系的好坏，不完全双列杂交用于评价种质遗传结构和配合力十分有用。

不完全双列杂交是指把供试亲本按试验要求分为两组，只进行组间杂交，不进行组内杂交。

在培育品种的过程中，常需要用一些骨干系对新的自交系进行测配，这就构成了不完全双列杂交，对这些数据的处理，常常依赖临近对照和类群来源，如果通过NC II数据分析，则可以得到更多的结果，更有利于指导实践。

对于不完全双列杂交，市面上有DPS、Win NC II等软件，但是结果单一，数据结构僵硬，而且对于处理缺失值性能有限，现在介绍GenStat软件处理不完全双列杂交中的应用，它本身的REML技术，可以估计BLUP值，能得到更精确的结果。

处理数据得到：一般配合力，特殊配合力，方差组分，遗传力，标准误，BLUP等值。

参考文献题目：

参考文献数据：

ABC为一组亲本，DEFG为另一组亲本，两组组间进行杂交，构成不完全双列杂交，数据如下：

论文中的结果：

1、方差分析

2、把组合的方差给剖分：

注意：模型I为固定效应，模型II为随机效应

3、两组亲本的一般配合力和特殊配合力：

4、配合力的相对效应：

注意：这就是一般配合力和特殊配合力除以整体平均数81.81的百分数结果。比如特殊配合力效应1.91就是1.56/81.81*100的结果。

5、配合力方差组分：

配合力所占百分数：

6、广义遗传率和狭义遗传率：

用GenStat软件处理数据流程：

1、  整理数据：分为父本群、母本群、区组、观测值（还可以加上地点、年限等）

2、  选择模型（得到配合力和F测验结果）

3、  配合力和方差检验

方差分析表：

配合力表：

配合力效应中给出了标准误，可以算出配合力效应0.05和0.01水平的LSD，用于计算配合力的显著性。

注意：相对配合力大小那实际配合力数值除以整体平均数即可。这里和文章的数值一样，但是软件给出了标准误值和最小显著差异值LSD，用于进一步的多重比较。

4、  选择模型（方差组分和遗传力结果）

5、  方差组分和遗传力：

注意：

广义遗传力：0.2946+0.3586+0.1710=0.8242

狭义遗传力：0.2946+0.3586=0.6532

这里不但给力亲本的方差组分，而且给出了对应的标准误，这是比文章中提高的地方。

6、  如果想计算亲本的BLUP值，GenStat也是可以实现的，模型如下：

结果：

如果拿配合力和BLUP值比较，发现会有部分差异，但是趋势基本相同，理论上用BLUP值当成育种值更精确。

如果想试用GenStat软件，请发信：姓名+单位+GenStat到China@vsni.co.uk

如果想分析相关数据，请加GenStat群：203276907

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