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非线性网络控制在合成基因网络上的实验实现
热度 1 2017-3-11 07:46
今天刚刚收到邮件,一个做了四年的工作被 elife 接收了。我们利用合成基因网络上实现了一个多稳态的系统,并利用顺序诱导的方法实现了多稳态共存。这个平台实际上是我们之前 Nature Comm 的实验实现和验证。 Engineeringof a synthetic quadrastable gene network to approach Waddington landscap ...
个人分类: 科研笔记|2417 次阅读|1 个评论 热度 1
第一篇NC文章~非线性网络控制
热度 6 2016-4-15 06:14
博文很久没有更新了~这段时间发生了很多事情,比如毕业了啊,当爹了啊,其实都可以上来灌个水,冒个泡啥的,就是自己太懒了~正好今天新出的NC文章online了,跟大伙报个喜也汇报下工作。 我到ASU读博士有两个方向,一个是和文旭师兄合作的利用compressive sensing重构网络 ...
个人分类: 科研笔记|6410 次阅读|12 个评论 热度 6
探测网络中的隐藏节点 续
热度 2 2014-3-14 02:18
我们在之前用压缩感知方法探测隐藏节点的工作基础上,继续发展了这套方法。主要思路是区分噪音和隐藏节点的区别,并且可以探测多个隐藏节点。 http://www.nature.com/srep/2014/140203/srep03944/full/srep03944.html Ascertaining the existence of hidden objects in a complex system, objects that c ...
个人分类: 科研笔记|3273 次阅读|2 个评论 热度 2
细胞在噪音影响下的分化 PNAS
热度 3 2014-3-14 02:15
这是我第一篇生物的文章,去年5月份接收的。我们利用合成生物学的技术,研究了细胞是在噪音影响下分化的过程。 http://www.pnas.org/content/110/26/10610.short Both microbes and multicellular organisms actively regulate their cell fate determination to cope with changing environments or to ens ...
个人分类: 科研笔记|3676 次阅读|4 个评论 热度 3
一个很有用的stem cell讨论版
热度 2 2012-10-24 02:28
http://www.stemcell8.cn/?fromuid=46431 干细胞之家。里面非常多电子书和相关的资料。 博士后面的时候应该大部分时间要花在干细胞分化和基因调控网络方面了。我的主要方向是用合成生物学的方法,研究噪音如何诱导细胞分化到不同的状态。我们和ASU的王晓老师( google scholar主页 )一起合作这方面的课题,王老师做 ...
个人分类: 科研笔记|3677 次阅读|3 个评论 热度 2
如何从时间序列识别网络中的隐藏节点
热度 6 2012-10-24 02:17
如何从时间序列识别网络中的隐藏节点
介绍一下我到来老师组之后的一个工作。 Detecting hidden nodes in complex networks from time series http://pre.aps.org/abstract/PRE/v85/i6/e065201 这篇文章是 旭哥 带我做的第二篇关于compressive sensing重构网络的文章。我们之前的思路基本上都是,给出每个节点上的时间序列,并假设我们对节点的可能动力学 ...
个人分类: 科研笔记|6149 次阅读|25 个评论 热度 6
推荐系统影响下的评价网络
2010-7-29 11:08
随着网络信息冗余度的增加,在无数的网络信息中找到自己需要的,或者说,碰到自己需要的不是一件容易的事情.我知道我有很多东西我能找到,因为有谷歌和百度;也知道我们有很多东西我们找不到,因为有GFW;我知道有多少东西我不知道,但是不怕,我有推荐系统;可是我不知道我有多少东西不知道,因为我还没有找到一个好用 ...
个人分类: 科研笔记|4665 次阅读|2 个评论
一篇很有意思的集群方面的文章
2010-7-28 14:46
这期PNAS上,我最崇拜的G.Parisi他们发的(我有他老人家的签名!嘿嘿),集群中的无标度关联。 Scale-freecorrelationsinstarlingflocks Cavagna,A;Cimarelli,A;Giardina,I;etal. PROCEEDINGS ...
个人分类: 科研笔记|4170 次阅读|3 个评论

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