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物种聚类的结果验证环境因子的差异的结果(mantel相关)

已有 2038 次阅读 2022-7-6 22:21 |个人分类:常规统计|系统分类:科研笔记

刚有一个学员问一个问题,就是怎么用物种聚类分析的f分组结果,来回答组间环境因子(具有定性环境因子)是否有差异?

回答:如果环境因子全部是定量,那可以将环境因子标准化后再进行多元方差分析(Manova)。如果是含有定性环境因子,那就麻烦一点,只能拿分组结果的做样方之间的0-1数据(在同一组为1,不同组为0)的Jaccard或是Sorensen系数相异系数矩阵,然后用环境因子的计算样方间的gower距离,最后做两个距离矩阵的Mantel相关,如果显著了,可以间接说明不同组之间是有显著差异的。



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