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带有显著性标记的相关性热图绘制方法
王敬敬 2020-7-21 10:52
带有显著性标记的相关性热图绘制方法 参考文献: https://www.jianshu.com/p/d86ddf8fd48f https://mp.weixin.qq.com/s/5tHE5apk2SwDmcSLYQx48Q #psych 包用于计算相关性、 p 值等信息 library(psych) #pheatmap 包用于绘制相关性热图 libra ...
个人分类: 生物信息学|9434 次阅读|没有评论
[转载]解决 Rtools is required to build R packages but is not current
王敬敬 2020-7-20 16:13
R 4.0 版本安装 rtools40教程,解决 Rtools is required to build R packages but is not currently installed 问题 Elendill 2020-04-30 16:55:41 10966 收藏 39 版权 正确安装Rtools 4.0 版本 出现的问题 解决方案 一、下载rtools 二、安装 三、配置rtools路径 1. 创建路径配置文件 ...
个人分类: 生物信息学|16630 次阅读|没有评论
利用本地blast进行特定物种的数量统计
王敬敬 2020-7-10 17:31
前期利用本地 BLAST 进行 FH-1/ 去嵌合体代表序列比对,发现 CK/FH 无显著差异,且 FH 量低于 CK 。深入分析,发现代表性序列是 97% 相似水平的 OTU 。应尝试 100% 相似性比对。 需要下载原始数据,抽平,比对,得到各个样品的比例,再进行比较。 ...
个人分类: 生物信息学|2643 次阅读|没有评论
[转载]fasta序列操作神器--seqkit
王敬敬 2020-7-10 11:22
转载自记号晴 https://www.cnblogs.com/huangyinger/p/10421805.html fasta序列操作神器——seqkit 一、序列操作: 1.取反向序列 seqkit seq test.fa -r test_re.fa 2.取互补序列 seq test.fa -p test_com.fa 3.取反向互补序列 seqkit seq test.fa -r -p test_re_com.fa 4.DNA序列转换为RNA ...
个人分类: 生物信息学|6598 次阅读|没有评论

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