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合成生物学的一个重要用途是从大量已有的化合物出发来生产高附加值的产品。如何基于已有的化合物前体来系统发现潜在可能的生物合成目标化合物,就需要生物合成反应大数据以及有关的信息化工具。 我们课题组为此专门为合成生物学开发的工具BioSynther: A Customized Biosynthetic Potential Explorer。今天被Bioinformatics接受了。在这个工具里面,我们采用了本领域最全面的生物合成反应数据(超过12万篇生物合成文献中的海量生物合成数据,以及BKM-react, Rhea反应数据)。BioSynther工具能帮助科研人员在线交互式地探索简单化合物前体的潜在生物合成候选化合物。这个工具对于代谢工程、合成生物学将有一定的作用。BioSyntheris目前可以在如下网站使用: http://www.lifemodules.org/biosynther/
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