生物技术创新创业分享 http://blog.sciencenet.cn/u/SNPs 美国HudsonAlpha研究院的研究员。做分子鉴别诊断平台技术的开发和免疫组库基础科研。

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多重PCR诊断试剂引物设计操作示范
热度 4 2011-6-20 02:31
有同行使用iCubate2.0以后不知到下一步如何做,这里试图介绍一下我们的经验。 iCubate2.0现阶段的一个局限就是没有做Sequence Alignment, 不能帮助找到靶基因的保守区。这个功能以后会加进去的,现在可以通过程序外面的一些运作来解决。下面的例子是假设我们要给一个大肠杆菌毒素基因设计引物。步骤如下: (1)google找 ...
个人分类: 多重PCR技术|14052 次阅读|5 个评论 热度 4
多重PCR(mPCR)为什么难?
热度 4 2011-6-11 23:55
上周末和周一用 iCubate2.0 iC-Architect软件 设计了一套多重PCR试剂,共八个靶点,加上内对照九个位点。这是一个新产品,临床应用的。 多重PCR之所以难做,问题的关键是多个靶点扩增条件不兼容 。每个靶点都需要两边的引物配合。打个比方,PCR就像“三条腿赛跑”: 每个靶点的成功扩增都需要被捆绑在一起的两个人( ...
个人分类: 多重PCR技术|16959 次阅读|6 个评论 热度 4
比较荧光实时PCR和arm-PCR的定量能力
热度 3 2011-1-27 01:41
许多先前在荧光定量PCR技术平台上开发产品的人都有一个根深蒂固的概念:实时PCR可以定量,而普通传统PCR是不能定量的。 这个连接 有比较详细的讲解。这个概念的产生是有道理的,请看下面大家都很熟悉的图: 不同模板浓度会得到不同的曲线,可是等反应到最后,大家都会达到一个共同的Plateau (平台)。因为传统PCR都是e ...
个人分类: 多重PCR技术|16647 次阅读|5 个评论 热度 3
雪中千里走单骑:从加拿大来的创新者
2010-12-12 02:41
在我以前的博客中有几次提到在加拿大温哥华妇女儿童医院的John Brunstein 博士( 关于猪流感在墨西哥死亡率高的一个假说 , 革命性的tem-PCR技术:公共卫生-呼吸道疾病 等)。 一个月前,收到他的电话,说他工作地方新换了领导,新领导不许他做与临床服务不直接相关的科研,所以他想换地方( 他个人的情况参见他的博客 ) ...
个人分类: 多重PCR技术|7476 次阅读|2 个评论
等论文发表菜都凉了
热度 1 2010-12-5 05:14
上个星期获悉,我们去年九月份递进去的论文终于被美国疾病预防控制中心主办的杂志, Emerging Infectious Diseases 发表了。期间因为发表有关流感的论文太多,加上论文被编辑遗忘遗失,和我对发表文章的不热心没有及时去催,所以才耽搁这么久。 这里可以下载论文。 这篇 ...
个人分类: 多重PCR技术|9016 次阅读|8 个评论 热度 1
PCR的悲喜剧
2010-11-28 06:02
应邀给AsiaBiotech杂志写了一篇介绍多重PCR的文章(点击图片看全文): 作为奖励,编辑部赠送给我一本书,让我从他们的出版物中挑选,我选择了这本有关PCR多聚酶的书: 之所以选这本书,是因为我一直觉得PCR还有很多改进的余地,而改进的诀窍可能就在多聚酶那里。 别忘了,PCR反应是 ...
个人分类: 多重PCR技术|10979 次阅读|2 个评论
Point of care 不等于小而快
2010-11-15 01:10
现在美国和中国的诊断行业都投入很多钱在Point of care诊断技术上。所谓Point of care就是在病人身边快速诊断。最佳的例子就是各种快速方便的血糖检测仪器或者是早孕检测试剂。 于是,人们就有了一个先入为主的概念:POC就是小,快,简便。 POC更应该重视的是临床价值,在确认了临床价值的前提下才能把东西做得小,快,简 ...
个人分类: 多重PCR技术|14202 次阅读|2 个评论
把PCR仪器做成家用电器
热度 1 2010-11-9 07:10
回国参加苏州BioBay的 生物技术风险投资论坛 ,现在在回家的路上。在日本中转候机,看到这个全自动的做咖啡的机器,让我想到如何能把生物技术也做到深入生活,让我们每天都能用上,走到那里都能看到。 说起来,手工做咖啡也已经很简单了:把磨碎的咖啡豆放道滤纸里面,加上水,一会就好了。这 ...
个人分类: 多重PCR技术|6625 次阅读|5 个评论 热度 1
又一个诊断公司并购大案
2010-10-25 23:38
今天的GenomWeb上有篇文章报道GE公司用$5.8亿美金收购Clarient. 而收购的一个主要原因是因为Clarient有一系列能和Genomic Health产品比美的肿瘤标记物,可以用来做肿瘤病人治疗疗效判别。 Genomic Health的拳头产品(服务)是OncoType Dx, 通过检测21个基因的表达图谱,给出乳腺癌病人用化疗的效益和风险。 Clarien ...
个人分类: 多重PCR技术|6351 次阅读|没有评论
诊断公司成了风投的新宠
2010-10-12 09:44
今天旧金山的一家风险投资公司(Bay City Capital) 来我们研究院访问,一行四人。我们研究院的院长,Rich Myers博士是这家公司的顾问,他们对我们研究院强调技术转化的模式很感兴趣:和一般的学校不同,我们从建院的时候就知道技术转化是首要目标之一。感兴趣的可以看看我以前写的一些 有关我们研究院的介绍 。 下午来访者 ...
个人分类: 多重PCR技术|6243 次阅读|3 个评论

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