xbinbzy的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/xbinbzy

博文

pandaseq在linux环境下的安装

已有 6819 次阅读 2016-7-13 15:12 |个人分类:科研文章|系统分类:科研笔记|关键词:学者| pandaseq

    根据https://github.com/neufeld/pandaseq/wiki/Installation提示,

   1)先在linux服务器上进行yum install zlib-devel bzip2-devel libtool-ltdl-devel libtool,其中libtool-ltdl-devel提示不存在这个包,暂时没管它;

   2)执行./autogen.sh,出现提示AM_PROG_AR的错误信息,采用https://github.com/google/protobuf/issues/152建议的策略进行处理,注释掉其中关于AM_PROG_AR的行

   3)./configure编译,报错信息如图

利用find命令去查找ltdl.h的路径,然后利用设置环境变量去处理,export  CFLAGS=-I/path/to/ltdl.h/ LDFLAGS=-L/path/to/ltdl.h/ LD_LIBRARY_PATH=/path/to/ltdl.h/$LD_LIBRARY_PATH,重新运行./configure,错误信息依然没变,尝试了不同的策略之后,错误信息一直存在,猜测是ltdl没有安装成功导致,为此进入ltdl.h的路径,进行ltdl.h的编译与安装,期间出现报错信息,利用find命令找到config-ml.in,然后拷贝到相应目录下,再重新./confiure&make&make install,最后ltdl.h安装成功。重新pandaseq的./configure运行,顺利进行;

   4)make,未见异常;

   5)make install,未见异常;

   6)最终,./pandaseq -h运行,成功安装,如下



https://m.sciencenet.cn/blog-306699-990437.html

上一篇:关于16s扩增区域选择的文章
下一篇:跟微生物组有关的商业公司

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-1 03:23

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部