文章： Na ̈ıve Bayesian Classifier for Rapid Assignment of rRNA Sequencesinto the New Bacterial Taxonomy RDP Classifier是基于朴素贝叶斯的原理进行分类，其中关键需要计算后先验概率和条件概率。 1）其中选择8-bp的subsequences作为特征序列去计算相应的概率 ...
文章： Development of a Dual-Index Sequencing Strategy and CurationPipeline for Analyzing Amplicon Sequence Data on the MiSeqIllumina Sequencing Platform 测序平台越来越丰富，考虑选择测序平台的时候主要考虑如下因素： 1） We contend thatsequence quality is the most important ...
文章：Can we predict future allergies from our infant gut microbiota？ Sensitization to food allergens is common during early life, affecting up to 28% of preschool children（学龄前的儿童多会发生食物过敏的情况）. While 66 – 90% of infants outgrow their sensitization t ...
Primer and platform effects on 16S rRNA tag sequencing （http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26300854） 第一、微生物研究中主要的技术应用历程 第二、对于phix的比例在16s中一直未见到较为公认的数值，此文中描述 Varying PhiX spi ...
在16s rRNA的分析中，在数据处理过程中重要的一步操作是鉴定和去除嵌合体。 嵌合体（chimera）产生的原因主要是PCR过程中产生的错误： During this PCR amplification，chimeras might be created due to incomplete extension. 在扩增过程中，chimera的比例 ...
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