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基于肠道微生物区分非酒精性脂肪肝: 肖斌 2017-7-5 22:02; 文章：Gut Microbiome-Based Metagenomic Signature forNon-invasive Detection of Advanced Fibrosis inHuman Nonalcoholic Fatty Liver Disease 杂志：Cell Metabolism 时间：2017 链接： http://sci-hub.cc/10.1016/j.cmet.2017.04.001 研究目的：Our aim was to develop a panel of gut micro-biome-derived ...; 个人分类: 科研文章|3058 次阅读|没有评论

妊娠期糖尿病和微生物: 肖斌 2017-7-5 15:19; 文章：Gestational Diabetes is associated with changes in Placental Microbiota and Microbiome 杂志：Pediatric RESEARCH 时间：2016 链接： http://sci-hub.bz/10.1038/pr.2016.155 研究目的：We profiled the placental microbiota and microbiome in women with gestational diabetes (GDM) ...; 个人分类: 科研文章|2676 次阅读|没有评论

小孩食物过敏与肠道微生物: 肖斌 2017-7-3 14:19; 文章：A prospective microbiome-wide association study of food sensitization and food allergy in early childhood 杂志：Allergy 时间：2017 链接： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28632934 研究目的： Our objective was to determine whether gut microbial composition was associated ...; 个人分类: 科研文章|2769 次阅读|没有评论

Latex使用overpic设置背景图片: 肖斌 2017-6-30 22:57; 在使用Latex时，可以利用overpic模块插入jpg、png、eps等图片，同时在图片可实现文字、新图片的插入，这两天查找实现实现overpic插入的图片作为背景图片，即离上下左右边界无距离，经过Google发现有如下解决方案，源代码如下： documentclass {ctexart} usepackage {overpic} usepackage{tikz} u ...; 个人分类: 数据分析|11091 次阅读|没有评论

MOCAT2使用过程中遇到的坑: 热度 2 肖斌 2017-6-30 19:25; 最近利用MOCAT2处理metagenome数据，在功能注释时遇到两个坑，记录分享一下 1）make_gene_catalog时，处理数据时发现step.4.seeds.padded没有结果 1.1 查看源码 cut -f 2,3,4,5,6,7 step.4.to.grep | $MC_BIN/cdbyank step.3.scaftigs.cidx -R -Q -x step.4.seeds.padded 1.2 查看工 ...; 个人分类: 数据分析|4643 次阅读|3 个评论热度 2

饮食调节体重、生理和心理状态: 肖斌 2017-6-29 20:31; 文章：Microbiome restoration diet improves digestion, cognition and physical and emotional wellbeing 杂志：PLOS ONE 时间：2017 链接： http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0179017 研究目的：探索一套饮食结构The Gut Makeover protocol对体重和生理、心理状态的影响 & ...; 个人分类: 科研文章|2376 次阅读|没有评论

痛风与肠道微生物: 肖斌 2017-6-28 17:49; 文章： Intestinal Microbiota Distinguish Gout Patients from Healthy Humans 杂志：Scientific Reports 时间：2016 链接： http://www.nature.com/articles/srep20602#t2 研究样本：总共83个样本，分成分析组（35例痛风样本、33例正常样本）和验证组（6例痛风样 ...; 个人分类: 科研文章|3433 次阅读|没有评论

metagenome实验设计需要注意的地方: 肖斌 2017-6-23 08:22; 文章：Optimizing methods and dodging pitfalls in microbiome research 时间：2017 杂志： Microbiome 影响metagenome数据产出的因素： 1）抗生素、药物的使用 2）年龄 3）饮食 4）地域 5）宠物 6）动物需要考虑饲养环境（例如小鼠存在吃便便的情况） 7）低起始量（多次的PCR，容易带来污染） 8 ...; 个人分类: 科研文章|2880 次阅读|没有评论

ARDB抗性基因数据库在Linux环境下的使用: 肖斌 2017-6-6 17:40; 对于ARDB的数据库介绍，可以参考 1） https://ardb.cbcb.umd.edu 2） http://www.sohu.com/a/141309825_278730 3） http://toolsbiotech.blog.fc2.com/blog-entry-41.html 4） http://www.novogene.com/tech/suppor/news/559.html 根据ARDB主页提示的数据下载路径，在Linux环境下：解压文件ARDBfla ...; 个人分类: 数据分析|6734 次阅读|没有评论

患湿疹孩子1岁内的肠道微生物变化: 肖斌 2017-5-19 09:13; 文章： Low diversity of the gut microbiota in infants with atopiceczema 时间：2011 研究目的： We have used barcoded16S rRNA 454-pyrosequencing to assess the microbial diversity and characterize the dominant bacteria in stool during the first year of life in infants who either h ...; 个人分类: 菌群|1741 次阅读|没有评论

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