博文

Rosalind 15 - Finding a Motif in DNA

2017-11-10 08:56

Bioinformatics Stronghold - SUBS: Finding a Motif in DNA Combing Through the Haystack 鉴定两个物种间共同的DNA片段是十分有意义的，这个共同的DNA片段可能在两个个体中的功能类似。 基序 （ motif ）定义为共同存在的DNA片段。分子生物学的一个共同的目标就是检索一个个体基因组以寻找已知的 ...

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Rosalind 13 - Mendel\'s First Law

2017-10-31 10:33

Bioinformatics Stronghold - IPRB: Mendel's First Law Introduction to Mendelian Inheritance 现代遗传法则是由Gregor Mendel首次在1865年提出。现代遗传模型，叫做 融合遗传 （ blending inheritance ），就是生物个体存在亲本双方的遗传性状。这个模型显然在经验和统计上都不成立，经验上存在很 ...

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Rosalind 12 - Counting Point Mutations

2017-10-28 08:39

Bioinformatics Stronghold - HAMM: Counting Point Mutations Evolution as a Sequence of Mistakes 突变 （ mutation ）是核酸链进行合成或者复制产生的错误。由于核酸对于细胞的功能是至关重要的，所以突变往往会引起细胞内的连锁反应，最终影响整个细胞。尽管突变是错误的，但一些罕见的突变对于细 ...

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Rosalind 11 - Computing GC Content

2017-10-27 10:54

Bioinformatics Stronghold - GC: Computing GC Content Identifying Unknown DNA Quickly 早期的计算软件会通过计算某一段文本中各字母出现的频率来区别不同语言。因为在一个足够长的文本中，同一语言会有其特征的字母频率。而计算软件会识别这种模式，从而准确判断出不同语言。 物种也是一样的，尽管 ...

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Rosalind 10 - Rabbits and Recurrence Relations

2017-10-26 08:41

Bioinformatics Stronghold - FIB: Rabbits and Recurrence Relations Wascally Wabbits 1902年，斐波纳契的Leonardo提出了一个关于兔子群体繁殖的数学算式，他首先提出以下几个基本假设： 第一个月，该群体只有一对新出生的兔子； 一个月之后，兔子进入繁殖期； 在之后的任何一个月，一只 ...

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Rosalind 9 - Complementing a Strand of DNA

2017-10-25 08:33

Bioinformatics Stronghold - REVC: Complementing a Strand of DNA The Secondary and Tertiary Structures of DNA 核酸链上的碱基排序构成了核酸链的 一级结构 （ primary structure ），但其并未解释核酸分子的三维结构。自从1953年 James Watson 和 Francis Crick 两位大神在 Nature 上发表了一 ...

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Rosalind 8 - Transcribing DNA into RNA

2017-10-24 08:32

Bioinformatics Stronghold - RNA: Transcribing DNA into RNA The Second Nucleic Acid 在染色质上与DNA一起的还有一种核酸叫做 核糖核酸 （ ribose nucleic acid ），简称为 RNA 。RNA与DNA不一样的地方在于其用 尿嘧啶 （ uracil ）替换了DNA上的胸腺嘧啶（thymine）。 Structural differen ...

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Rosalind 7 - Counting DNA Nucleotides

2017-10-23 08:30

Bioinformatics Stronghold - DNA: Counting DNA Nucleotides A Rapid Introduction to Molecular Biology 细胞 （ cell ）是一切生物体功能的基本单位。 细胞核 （ nucleus ）是真核生物细胞的组分，是细胞活动的中心。细胞核充满了一种叫做 染色质 （ chromatin ）的大分子，在真核细胞 有丝分裂 （ mi ...

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Rosalind 6 - Dictionaries

2017-10-22 08:28

Python Village - INI6: Dictionaries Intro to Python dictionary Python中除了lists和strings存储和处理数据，还有一种变量叫做 dictionary ，其类似于lists，但存储的对象有所区别，比如我们可以用以下的方法创建一个dictionary： phones = {'Zoe':'232-43-58', 'A ...

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