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mSystems:苏晓泉、徐健-基于大数据引擎的全球微生物组转化网络
刘永鑫 2021-7-21 22:43
一个无标度、完全关联的全球转化网络是已知微生物组多样性的基础 A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlies Known Microbiome Diversity mSystems DOI: https://doi.org/10.1128/mSystems.00394-21 发表日期:2021-07-13 第一作者:Gongchao Jing a,d , Yufeng Zhang b 通 ...
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NC:王金锋等揭示阴道菌群异位对子宫健康的影响
刘永鑫 2021-7-14 19:57
阴道菌群的易位与子宫健康的损伤和保护有关 Translocation of vaginal microbiota is involved in impairment and protection of uterine health Nature Communications DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-24516-8 发表日期:2021-07-07 第一作者:Jinfeng Wang(王金锋) 1,2,7 ,Zhanzhan Li(李占 ...
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NC:中农徐凌组和UC伯克利Coleman-Derr组-植物与根际微生物在干旱下的互作机制
刘永鑫 2021-7-4 22:23
基因组水平的宏基因组学揭示了铁代谢在干旱诱导的根际微生物组动态中的作用 Genome-resolved metagenomics reveals role of iron metabolism in drought-induced rhizosphere microbiome dynamics Nature Communications DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23553-7 原文链接: https://www.nature ...
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NC:噬菌体中无机硫辅助代谢基因的生态学研究
刘永鑫 2021-6-28 23:10
翻译:周之超@UW-Madison 广泛存在的噬菌体中无机硫辅助代谢的生态学 Ecology of inorganic sulfur auxiliary metabolism in widespread bacteriophages Nature Communications DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23698-5 原文链接: https://www.nature.com/articles/s41467-021-23698-5 发 ...
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关于植物和共生微生物,这116张PPT讲明白了(值得收藏!)
刘永鑫 2021-6-15 21:17
这个PPT描述了两种非常亲密的共生关系:一种是在细菌(根瘤菌或Frankia)与其寄主植物之间发生的,导致固氮根瘤的产生。另一个是两种不同类型的菌根真菌与其寄主植物之间的相互作用,导致营养吸收增加。这些互惠共生体的成功形成是一个复杂的过程,需要信号传导和识别,形态和生理反应以及植物和共生微生物的生化作用。这 ...
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NBT:人类肠道培养细菌的1520个基因组
刘永鑫 2021-6-12 10:25
人类肠道培养细菌培养组的参考基因组集 人类肠道培养细菌的1520个基因组扩展微生物组功能分析 1,520 reference genomes from cultivated human gut bacteria enable functional microbiome analyses Nature Biotechnology 2019-04-04 Articles DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-018-0008-8 全 ...
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Nature 子刊:三代测序的DNA提取和宏基因组学分析
刘永鑫 2021-5-15 11:57
改进的人类肠道微生物组的高分子量DNA提取,纳米孔测序和宏基因组学装配 Improved high-molecular-weight DNA extraction, nanopore sequencing and metagenomic assembly from the human gut microbiome Nature Protocols DOI: https://doi.org/10.1038/s41596-020-00424-x 发表日期:2020-12-04 第一作 ...
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Nature子刊:英属哥伦比亚大学揭示植物塑造根际微生物组新机制
刘永鑫 2021-5-10 19:22
FERONIA通过调节活性氧来限制根际微生物组中的假单胞菌 FERONIA restricts Pseudomonas in the rhizosphere microbiome via regulation of reactive oxygen species Nature plants DOI: https://doi.org/10.1038/s41477-021-00914-0 发表日期:2021-05-10 第一作者:Yi Song(宋毅) 1,2 通讯作者:Car ...
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Microbiome:animalcules-交互式微生物组分析和可视化的R包
刘永鑫 2021-4-28 22:23
animalcules-交互式微生物组分析和可视化的R包 animalcules: interactive microbiome analytics and visualization in R Microbiome DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-021-01013-0 发表日期:2021-03-28 第一作者:Yue Zhao 1,2 ,Anthony Federico 1,2 通讯作者:W. Evan Johnson (wej@bu.edu) 1,2 ...
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Cell:人体肠道菌群的长期遗传稳定性和个体特异性
刘永鑫 2021-4-9 23:37
Cell:人体肠道菌群的长期遗传稳定性和个体特异性 本文由小贤哥(胡世贤)编译 The long-term genetic stability and individual specificity of the human gut microbiome Cell DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.03.024 发表日期:2021-4-9 第一作者:Lianmin Chen(陈连民) 1,2 通讯作者 ...
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