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Microbiome:南京农大团队在粘细菌捕食的生态学功能方面取得重要进展
刘永鑫 2020-6-9 20:40
掠食性粘细菌通过调节土壤微生物群落来控制黄瓜枯萎病 A predatory myxobacterium controls cucumber Fusarium wilt by regulating the soil microbial community Microbiome Impact Factor 10.465 DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-020-00824-x 发表日期:2020-04-06 第一作者:叶现丰 1† , ...
个人分类: 读文献|2456 次阅读|没有评论
Microbiome:华中农大谢卡斌组利用CRISPR系统改进16S rRNA基因测序宿主污染问题
刘永鑫 2020-6-9 19:04
利用CRISPR/Cas9系统可减少基于16S rRNA基因扩增子测序中大量的宿主污染 Engineering CRISPR/Cas9 to mitigate abundant host contamination for 16S rRNA gene-based amplicon sequencing Microbiome Impact Factor 10.465 DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-020-00859-0 发表日期:2020-06-03 第 ...
个人分类: 作者解读|4523 次阅读|没有评论
211.Alpha多样性箱线图(样章,11图2视频)
刘永鑫 2020-6-8 00:09
《微生物组数据分析与可视化实战》专著 众筹编写《微生物组数据分析与可视化实战》——成为宏基因组学百科全书的创始人(目录) 编者序:初衷、计划、要求、优势、目标和展望 本文为样章,211代表目录中的第二章,第一节的第一部分,部分引用格式文字为格式说明。 每节的基本逻辑:背景知识 —— 实例解读 —— ...
个人分类: 微生物组专著|8586 次阅读|没有评论
编者序:初衷、计划、要求、优势、目标和展望
刘永鑫 2020-6-5 22:19
020编者序 写在前面 2020年4月底,宏基因组公众号编辑部内部启动了《微生物组数据分析和可视化实战》专项计划(又名《宏基因组学百科全书》),该项目是对2017年以来宏基因组公众号发布的上千篇原创文章进行系统的总结和更新,希望在接下来一年以时间里,初步形成一套对本领域新人入门的教材,同时是专业同行查找相关资源 ...
个人分类: 读文献|1681 次阅读|没有评论
Microbiome:中外合作揭示微生物群落降解复杂微生物聚合物的酶(视频导读)
刘永鑫 2020-6-3 00:32
培养及非培养宏基因组技术揭示微生物群落降解复杂微生物聚合物的遗传和酶活潜力 Cultivation-independent and cultivation-dependent metagenomes reveal genetic and enzymatic potential of microbial community involved in the degradation of a complex microbial polymer Microbiome 【 Impact Factor 10 ...
个人分类: 作者解读|6814 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 32如何写方法和引用Citing(2020.2)
刘永鑫 2020-5-26 19:19
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
个人分类: QIIME2|2034 次阅读|没有评论
JoVE微生物组专刊征稿,写方法拍视频教程发SCI(宏基因组公众号专属福利)
刘永鑫 2020-5-25 23:07
JoVE 视频实验杂志 官网: https://www.jove.com/ 包括上万个实验和分析方法视频,还有几十个领域的数百个专业视频教程资源。 这个杂志被SCI收录了吗?必须的。杂志在Web of Science中JCR信息如下: 2年影响因子 1.1,5年影响因子1.6。杂志和视频需要订阅才能访问,一定成度限制了传播和引用,但今年开始允 ...
个人分类: 新闻|3777 次阅读|没有评论
QIIME 2教程. 31名词Glossary(2020.2)
刘永鑫 2020-5-25 20:18
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
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QIIME 2教程. 30补充资源SupplementaryResources(2020.2)
刘永鑫 2020-5-24 16:20
前情提要 NBT:QIIME 2可重复、交互式的微生物组分析平台 1简介和安装IntroductionInstall 2插件工作流程概述Workflow 3老司机上路指南Experienced 4人体各部位微生物组分析Moving Pictures Genome Biology:人体各部位微生物组时间序列分析 5粪菌移植分析练习FMT Microbiome:粪菌移植改善自 ...
个人分类: QIIME2|1676 次阅读|没有评论

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