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BMC Biology:香港城市大学孙燕妮组发表高准确度预测病毒宿主的工具
刘永鑫 2022-1-27 18:42
使用基于 GCN 的半监督学习预测原核病毒的宿主 Predicting the hosts of prokaryotic viruses using GCN-based semi-supervised learning BMC Biology DOI: https://doi.org/10.1186/s12915-021-01180-4 发表日期:2021-11-24 第一作者: Jiayu SHANG(商家煜) 1 通讯作者:Yanni SUN(孙燕妮)(yannis ...
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Nature子刊:来自人类肠道菌群的189,680种DNA病毒基因组集
刘永鑫 2022-1-26 23:17
翻译:周之超@UW-Madison 来自人类肠道菌群的 189,680 种 DNA 病毒的宏基因组汇编 Metagenomic compendium of 189,680 DNA viruses from the human gut microbiome viruses Nature Microbiology DOI: https://doi.org/10.1038/s41564-021-00928-6 发表日期:2021-06-24 第一作者:Stephen Nayfach 1,2 ...
个人分类: 宏基因组|909 次阅读|没有评论
Nature子刊:宏基因组组装基因组实现谱系解析
刘永鑫 2022-1-19 19:46
宏基因组组装基因组实现谱系解析 MAGs achieve lineage resolution Nature Microbiology DOI: https://doi.org/10.1038/s41564-021-01027-2 发表日期:2022-01-03 第一作者:Taylor E. Reiter 1 通讯作者:C. Titus Brown (ctbrown@ucdavis.edu) 1 主要单位: 1 美国加州大学戴维斯分校(Department ...
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ISME:林科院袁志林等-冷杉优势真菌共生发育的基因家族趋同演化及平衡选择机制
刘永鑫 2022-1-13 22:02
ISME:林科院袁志林等-冷杉优势真菌共生发育的基因家族趋同演化及平衡选择机制 百山祖冷杉相关真菌的基因组概况揭示了对内生菌的快速收敛适应 Genomic landscape of a relict fir-associated fungus reveals rapid convergent adaptation towards endophytism The ISME Journal DOI: https://doi.org/10.10 ...
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微生物组数据揭示中国稻谷产毒真菌分布及仓储动态变化
刘永鑫 2022-1-11 20:14
中国水稻主产区产毒真菌的分布 Distribution of mycotoxin-producing fungi across major rice production areas of China Food Control DOI: https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2021.108572 发表日期:2021-11-12 中国两大仓库稻谷中微生物群落的时空变化 Temporal and spatial variation of micr ...
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mSystems:“地球第四极”马里亚纳海沟极端环境中神秘的底栖病毒群落及其生态功能
刘永鑫 2022-1-10 15:53
新型病毒群落可能有助于马里亚纳海沟上坡沉积物中的碳、氮和硫代谢 Novel Viral Communities Potentially Assisting in Carbon, Nitrogen, and Sulfur Metabolism in the Upper Slope Sediments of Mariana Trench mSystems DOI: https://doi.org/10.1128/msystems.01358-21 发表日期:2022-01-04 第一作 ...
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美国俄克拉荷马大学秦玮课题组招聘启事
刘永鑫 2022-1-7 22:17
美国俄克拉荷马大学(University of Oklahoma)秦玮课题组招聘启事(博士、博后) 一、课题组PI简介 秦玮,美国俄克拉荷马大学(University of Oklahoma),助理教授(Assistant Professor) 。 2006-2010,北京师范大学环境科学,学士学位; 2010-2016,美国华盛顿大学(University of Washington, Seattle)环境微生物 ...
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Science:无氧世界的古菌氨氧化
刘永鑫 2022-1-7 22:11
无氧世界的古菌氨氧化(古菌通过自身产氧维持其在无氧环境中好氧氨氧化) Archaeal nitrification without oxygen(The single-cell organism can self-produce oxygen for ammonia oxidation) Science DOI: https://DOI.org/10.1126/science.abn0373 发表日期:2022-01-06 第一作者:Willm Martens-Habbena ...
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Bioinformatics:吉林大学刘富组-深度学习从宏基因组序列中识别短病毒序列Virtifier
刘永鑫 2022-1-7 20:52
Virtifier: 基于深度学习方法的宏基因组病毒序列分类方法 Virtifier: a deep learning-based identifier for viral sequences from metagenomes Bioinformatics DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab845 发表日期:2021-12-15 第一作者:Yan Miao(苗岩) (miaoyan17@mails.jlu.edu.cn) 1 ...
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iMeta期刊推特官方帐号@iMetaJournal上线
刘永鑫 2022-1-3 22:00
为增强iMeta期刊在海外的社交媒体宣传,现开通iMeta期刊的推特(twitter)的官方帐号 @iMetaJournal 主页: https://twitter.com/imetajournal 欢迎广大同行帮忙分享/转发关于iMeta期刊的相关资讯。 期刊简介 “ iMeta ” 是由威立、肠菌分会和本领域数百位华人科学家合作出版的开放获取期刊,主编由中科院微 ...
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