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浅析R语言非参数检验的多组比较及分面与分组的图形艺术
刘永鑫 2021-8-15 19:45
浅析R语言多组定量资料非参数检验的多组比较及簇状柱形图显著性字母标记之分面与分组的图形艺术 R语言多组定量资料非参数检验的多组比较 非参数检验的应用 本流程是在刘永鑫老师提供的代码资料指导下完成 测试数据及代码链接: https://pan.baidu.com/s/1s0IX2eVe34jL2DViWCvZfQ 提取码:dunw 链接失败,请回复”多 ...
个人分类: R|3411 次阅读|没有评论
Microbiome:生态中心张丽梅组-植物发育时期驱动玉米微生物组生态角色的分化
刘永鑫 2021-8-15 16:30
植物发育时期驱动玉米微生物组生态角色的分化 Plant developmental stage drives the differentiation in ecological role of the maize microbiome Microbiome DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-021-01118-6 发表日期:2021-08-13 第一作者: Chao Xiong(熊超)(cxiong_eco@163.com) 1,2 通讯作者 ...
个人分类: 读文献|1153 次阅读|没有评论
SCLS:微生物所方荣祥/张莉莉团队开发植物内生细菌特异16S引物
刘永鑫 2021-8-7 13:48
设计细菌特异性16S引物对植物内生细菌组进行测序和定量分析 Designing specific bacterial 16S primers to sequence and quantitate plant endo-bacteriome SCIENCE CHINA Life Sciences DOI: https://doi.org/10.1007/s11427-021-1953-5 发表日期:2021-07-22 第一作者:Liying Chen (陈丽莹) 1,2 ,Meng ...
个人分类: 作者解读|2479 次阅读|没有评论
Nature子刊:Sundaresan组-水稻长期干旱之后持续性的扰乱微生物组构成(宋毅点评)
刘永鑫 2021-8-2 22:33
论文题目:长期干旱使水稻根系微生物组组成发生持久性的变化 Prolonged drought imparts lasting compositional changes to the rice root microbiome DOI: https://doi.org/10.1038/s41477-021-00967-1 评论文章题目:干旱抑制微生物组发育 Drought dampens microbiome development Nature plants ...
个人分类: 读文献|1411 次阅读|没有评论
你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(2021.8)
刘永鑫 2021-8-1 17:26
宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强宏基因组学技术和成果交流传播,推动全球华人微生物组领域发展,中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号,联合海内外同行共同打造本领域纯干货技术及思想交流平台。 公众号每日推送,工作日分享宏基因组领域最新成果、科研思路、实验和分析技术,理 ...
个人分类: 经验|3043 次阅读|没有评论
EZBioCloud:16S和宏基因组物种注释和新种鉴定
刘永鑫 2021-7-28 20:56
简介 https://www.ezbiocloud.net/ 是综合的细菌16S鉴定数据库,所有16S序列经人工校正,几乎全部为完整27F-1492R全长16S序列,而且全面覆盖NCBI、JGI的16S和细菌基因组,以及PacBio测序的16S全长序列。数据库每季度更新,近10年来被引用过万次。 由ChunLab维护的专门针对细菌、古菌16S rRNA基因的数据库,但与Greeng ...
个人分类: 软件|5037 次阅读|没有评论
mSystems:苏晓泉、徐健-基于大数据引擎的全球微生物组转化网络
刘永鑫 2021-7-21 22:43
一个无标度、完全关联的全球转化网络是已知微生物组多样性的基础 A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlies Known Microbiome Diversity mSystems DOI: https://doi.org/10.1128/mSystems.00394-21 发表日期:2021-07-13 第一作者:Gongchao Jing a,d , Yufeng Zhang b 通 ...
个人分类: 读文献|979 次阅读|没有评论
NC:王金锋等揭示阴道菌群异位对子宫健康的影响
刘永鑫 2021-7-14 19:57
阴道菌群的易位与子宫健康的损伤和保护有关 Translocation of vaginal microbiota is involved in impairment and protection of uterine health Nature Communications DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-24516-8 发表日期:2021-07-07 第一作者:Jinfeng Wang(王金锋) 1,2,7 ,Zhanzhan Li(李占 ...
个人分类: 读文献|1023 次阅读|没有评论
PICRUSt2分析实战:16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组、新增KEGG层级
热度 1 刘永鑫 2021-7-8 22:27
PICRUSt2分析实战:16S扩增子OTU或ASV预测宏基因组、新增KEGG层级 更新时间:2021年7月8日 PICRUSt推出了近8年,引用5000余次。 现推出PICRUSt2,202年再次霸气发表于顶级期刊Nature Biotechnology,原文解读详见: NBT:PICRUSt2预测宏基因组功能 主页: https://github.com/picrust/picrust2 具有以下 ...
个人分类: 扩增子|3790 次阅读|2 个评论 热度 1
NC:中农徐凌组和UC伯克利Coleman-Derr组-植物与根际微生物在干旱下的互作机制
刘永鑫 2021-7-4 22:23
基因组水平的宏基因组学揭示了铁代谢在干旱诱导的根际微生物组动态中的作用 Genome-resolved metagenomics reveals role of iron metabolism in drought-induced rhizosphere microbiome dynamics Nature Communications DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23553-7 原文链接: https://www.nature ...
个人分类: 读文献|1259 次阅读|没有评论

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