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2021版宏基因组、微生物、环境杂志IF及变化分析
刘永鑫 2021-7-1 10:09
以下是按类筛选的杂志,包括 宏基因组、微生物、生物技术和应用微生物、环境科学各分领域的杂志精选,以及变化分析​ 宏基因组、微生物组文章频发杂志精选 Rank Full Journal Title IF2020 IF2019 Change 3 NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE 91.245 74.699 16.546 5 LANCET 79.321 60.392 ...
个人分类: 新闻|1364 次阅读|没有评论
NC:噬菌体中无机硫辅助代谢基因的生态学研究
刘永鑫 2021-6-28 23:10
翻译:周之超@UW-Madison 广泛存在的噬菌体中无机硫辅助代谢的生态学 Ecology of inorganic sulfur auxiliary metabolism in widespread bacteriophages Nature Communications DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-23698-5 原文链接: https://www.nature.com/articles/s41467-021-23698-5 发 ...
个人分类: 读文献|1599 次阅读|没有评论
75分钟入门微生物组数据分析和结果解读—刘永鑫(合肥,2021年6月23日)
刘永鑫 2021-6-23 23:24
感谢中科院南京土壤所褚海燕老师的邀请,参加《土壤生物多样性与生物化学过程研讨会》的《微生物生态与生物信息技术培训》专场。 本次会议800余人的规议,第三天现场仍然座无虚席如下: 报告现场 讲台 观众 茶歇讨论 我现将本次75分钟报告《微生物组数据分析和结果解读》现将现场录屏视频和PPT分享给大家 ...
个人分类: 培训|1113 次阅读|没有评论
青年生命科学论坛报告:扩增子和宏基因组数据分析与可视化流程—刘永鑫(北京210606)
刘永鑫 2021-6-18 23:27
感谢中科院动物所青促会组织的第三届青年生命科学论坛的邀请,参加本次大会,并和微生物所王军老师共同负责了《微生物组》专题的召集工作。感谢11位微生物组专题报告人的辛苦准备和分享。 现将本次15分钟报告《扩增子和宏基因组数据分析与可视化流程》录屏视频和PPT分享给大家。 视频在线观看链接: https://v.qq.c ...
个人分类: 经验|680 次阅读|没有评论
关于植物和共生微生物,这116张PPT讲明白了(值得收藏!)
刘永鑫 2021-6-15 21:17
这个PPT描述了两种非常亲密的共生关系:一种是在细菌(根瘤菌或Frankia)与其寄主植物之间发生的,导致固氮根瘤的产生。另一个是两种不同类型的菌根真菌与其寄主植物之间的相互作用,导致营养吸收增加。这些互惠共生体的成功形成是一个复杂的过程,需要信号传导和识别,形态和生理反应以及植物和共生微生物的生化作用。这 ...
个人分类: 读文献|1066 次阅读|没有评论
NBT:牛瘤胃微生物组的4941个宏基因组组装基因组(MAG)
刘永鑫 2021-6-13 12:08
牛瘤胃微生物组的参考基因组集 用于瘤胃微生物组生物学和酶发现的4,941个瘤胃宏基因组组装基因组集 Compendium of 4,941 rumen metagenome-assembled genomes for rumen microbiome biology and enzyme discovery Nature Biotechnology 2019-08-02 Articles DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-01 ...
个人分类: 宏基因组|2667 次阅读|没有评论
NBT:人类肠道培养细菌的1520个基因组
刘永鑫 2021-6-12 10:25
人类肠道培养细菌培养组的参考基因组集 人类肠道培养细菌的1520个基因组扩展微生物组功能分析 1,520 reference genomes from cultivated human gut bacteria enable functional microbiome analyses Nature Biotechnology 2019-04-04 Articles DOI: https://doi.org/10.1038/s41587-018-0008-8 全 ...
个人分类: 读文献|2797 次阅读|没有评论
Nature 子刊:三代测序的DNA提取和宏基因组学分析
刘永鑫 2021-5-15 11:57
改进的人类肠道微生物组的高分子量DNA提取,纳米孔测序和宏基因组学装配 Improved high-molecular-weight DNA extraction, nanopore sequencing and metagenomic assembly from the human gut microbiome Nature Protocols DOI: https://doi.org/10.1038/s41596-020-00424-x 发表日期:2020-12-04 第一作 ...
个人分类: 读文献|1754 次阅读|没有评论
Nature子刊:英属哥伦比亚大学揭示植物塑造根际微生物组新机制
刘永鑫 2021-5-10 19:22
FERONIA通过调节活性氧来限制根际微生物组中的假单胞菌 FERONIA restricts Pseudomonas in the rhizosphere microbiome via regulation of reactive oxygen species Nature plants DOI: https://doi.org/10.1038/s41477-021-00914-0 发表日期:2021-05-10 第一作者:Yi Song(宋毅) 1,2 通讯作者:Car ...
个人分类: 读文献|1744 次阅读|没有评论

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