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在我的机群中增加一台节点机的详细过程
2024-4-20 23:00
1. 在 mu01 上 scp .ssh/id_rsa.pub cu35: scp .ssh/id_rsa cu35: 在 cu35 上 cd .ssh mv ../id_rsa.pub authorized_keys ; chmod 600 authorized_keys 2.&n ...
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Lustre (infiniband)客户端安装记录
2022-12-18 20:26
上次安完就忘了细节,这次又捉摸了半天。这次记得清晰一点。 操作系统: CentOS 8.3 客户端所需要的包的下载地址: Index of /public/lustre/lustre-2.14.0-ib/MOFED-5.2-1.0.4.0/el8.3.2011/client/RPMS/x86_64 (whamcloud.com) 1)需要下载的包: ibutils2-2.1.1-0.128.MLNX20201210.g311e385.52104.x86_64.rpm&nbs ...
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Cp2k 2022.1安装记录
2022-12-17 21:03
Cp2k 2022.1安装记录 1) 编译器 module load compiler/2022.0.2 module load mkl/2022.0.2 module load mpi/2021.5.1 2) 下载cp2k2022.1,解压。 3) 下载 cmake-3.22.1-Linux-x86_64.sh; libint-v2.6.0-cp2k-lmax-5.tgz; libxsmm-1.17.tar.gz; elpa-2021.11.002.tar.gz; libxc-5. ...
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我的Lustre安装记录
2022-11-25 23:01
服务端是CENTOS 7.9 顺序: 1.install the OS, 2. install the infiniband driver from the lustre web.(需要卸载掉mlnx的原有驱动) 如果ib0看不到: sudo modprobe -rv ib_isert rpcrdma ib_srpt sudo service openibd start 3.install the Kernel downloaded from the lustre web. 4. install t ...
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Extended Huckel Molecular Orbital Program (EHMO程序一枚)
2022-11-13 20:18
为了更方便的在教学过程中展示分子轨道,特别是展示HC=SCE这一过程,写了一个扩展的休克尔分子轨道程序。可以打开分子的xyz文件,或直接copy一个分子的xyz坐标到主窗口中,直接点击计算后就可以显示轨道了,当然还可以输出各种矩阵。 可以按c键将轨道的图型保存到剪贴板中。 程序主要是为了给本科生或研究生上课 ...
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写了一个查看CP2K所得DOS文件的软件 (CP2K DOS Viewer)
2022-10-24 19:46
写了一个查看CP2K所得DOS文件的软件 (CP2K DOS Viewer) 用cp2k计算dos,会生成*.pdos文件,其给出个各个轨道中s,p,d等所占的比例。用gaussian或 Lorentz 方法展开后,就会得到态密度数据。但手动操作比较烦人,同时,有的时候我们需要简单的先看一看数据。为此,写了一个简单的CP2K DOS Viewer,可以直接打开*.pdos文 ...
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用SimplerViewer建立一个表面模型
2022-10-20 11:29
用SimplerViewer建立一个表面模型 SimpleViewer的下载地址: https://kdocs.cn/l/ckzOzbiYtsoi (1)用SimpleViewer打开一个CIF文件: (2)按一下”b”键可显示晶胞盒子 (3)点击工具栏上的Createsurface (4) 输入hkl各层数及真空层的大小,点击OK (5)鼠标右键点击Create Supper Cell生成合适大 ...
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SimpleViewer 一个简单实用的结构化学对称性教学软件
2022-10-20 11:27
SimpleViewer 一个简单实用的结构化学对称性教学软件 我们基于QGLViewer,用C++(QT)打造的SimpleViewer软件,可以识别分子的对称性,显示对称元素。本软件可运行在Windows,Linux平台。 根据输入的分子,可自动识别对称性。 可以显示所有对称元素。 简单的使用说明。 Simple Viewer: 关于文件的打开: ...
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