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“细读”多伦多大学:毕业论文

已有 2638 次阅读 2020-3-15 08:38 |个人分类:本科教育|系统分类:科研笔记|关键词:学者

   


             

       多伦多大学大本科毕业论文是以课程形式开展的.想做毕业论文的学生,选择规定的课程Special Project,需要一年的两个学期的时间,在自选的导师指导下参与课题研究,并撰写课题报告,举行课题答辩,取得响应的课程成绩与学分.如果不想做毕业论文,则可以选同等级的课程来修,通过考试,获得成绩与学分.这样的设计比较灵活,又给予学生选择的自由.有意愿科研训练的学生,Special Project是一个很好的选择,可以初步进行科学研究能力的培养;不少大学生就是通过毕业论文研究,直接申请研究生成功的把握很大,因为多伦多大学的研究生(硕士生,博士生),既没有统一考试,也没有保送,只有申请一条路,那么,参加Special Project比较容易被指导教授识别出来.如果本科毕业后想立即就业,不妨可以不选Special Project课程,不做毕业论文,那么,多修一些拓展知识领域的课程,未必不是一种合理的选择.

         儿子在大四选了MGY480Y1 Special Project课程,并选定大三MGY311Y1课程论文的指导教师为毕业论文的指导教师爱德华兹(Aled M Edwards,1962.6.1-),他是世界著名的结构生物学家,他不仅是多伦多大学分子遗传学系教授,而且也是班廷与白斯特医学研究部、医学生物物理系教授,同时还是国际结构基因组学联盟(Structural Genomics Consortium, SGC)主席,英国牛津大学客座教授。

       由于爱德华滋教授科研任务很重,研究经费充足,在多伦多大学校园附近的科学园区内设有研究机构,只招博士后从事科学研究,不太愿意培养博士或硕士。在儿子强有力的申请下,再加上大三他开设课程中布置作业,儿子完成的比较好,多伦多大学教授又有培养本科生的义务,爱德华兹教授勉强收了他,但不准备接受儿子的研究生申请。儿子恰好不想在多大读研究生.爱德华滋教授要求儿子与博士后们做一样的课题,只是规模小一点.同时答应,课题完成之后,共同出一篇文章.儿子还做好大学毕业后的暑期,继续课题研究。

     爱德华兹是1988年在麦吉尔大学(McGill University)获得生物化学博士学位的,时年26岁。之后到斯坦福大学Roger Kornberg( Roger David Kornberg,1947 年-)教授的实验室做博士后研究。罗杰·大卫·科恩伯格因“真核细胞转录分子基础方面的研究”获得2006 年诺贝尔化学奖.罗杰·大卫·科恩伯格是著名的生物化学家阿瑟·科恩伯格(Arthur Kornberg) 的长子,阿瑟由于DNA 聚合酶的发现而分享了1959年的诺贝尔生理与医学奖。那年罗杰跟随父亲出席了在斯德哥尔摩的诺贝尔奖颁奖演讲会,使他确定了献身科学的决心,并最终也获得诺贝尔奖。科恩伯格父子是获得诺贝尔奖的第六对父子。

        爱德华兹开创的学术领域可以称之为结构基因组学,他是该领域的先驱之一,而且是坚持时间最长、研究规模最大、成果最丰富的结构蛋白质科学家之一。当大多数结构生物学家都从事单个蛋白质或蛋白质群的研究,而爱德华兹则从事大范围基因蛋白质组的研究。自从1990年以来,爱德华兹一直是结构蛋白质领域的先锋,他的研究小组,决定了数百个蛋白质结构或者蛋白质片断,并且录入RCSB(一个免费的蛋白质三维结构的在线数据库)数据库,免费提供了医学研究人员作为研究工具来解释复杂的疾病和发现新的药物。

        最近十年,基因组测序能力和获取信息能力的提高激起了科学家们的新梦想,他们希望利用基因组测序项目的信息,以自动化、高通量的方式快速确定蛋白质的结构。为此,爱德华兹还与牛津大学结构基因组协会首席科学家Michael Sundstrom合作编撰了《结构基因组学和高通量结构生物学》(Structural Genomics and High Throughput Structural Biology)一书,从基本发现到实际应用两个方面系统而全面的阐述了结构蛋白组学,重点在于指导读者如何应用结构学信息解释基因组序列和功能之间的关系。同时,书中列举了当今世界前沿科学家的工作,意在使读者能从他们丰富的实际经验中有所收获。

      结构基因组学是一门研究生物中所有蛋白质结构的科学。通过对蛋白质结构的分析,可大致了解蛋白质的功能。结构基因组学重视快速、大量的蛋白质结构测定,而快速结构测定技术正是该学科研究面临的一个瓶颈问题。目前通常使用的两种测定技术,X射线晶体衍射和核磁共振质谱技术,虽然精确,但速度很慢,测定一个基因的蛋白质结构,动辄就需要几年的时间。随着新发现的蛋白质及蛋白质复合物越来越多,目前的分析速度远远不能满足研究的需要。了解蛋白质的结构可设计与之相互作用的药物。比如,SGC最近公布了一种人类酶的三维结构,这种酶将可的松转化成代谢激素考的索。爱德华兹说:“缺少这种酶的小鼠无论吃什么都不会患上糖尿病。所以这个目标让制药业非常激动。” 

      爱德华兹等人创办的SGC,由设在斯德哥尔摩、多伦多、牛津的实验室构成,主要借助高通量技术,解析具有医疗价值的蛋白质的结构,并将获得的蛋白质结构的数据存储与免费开放的数据库。SGC一期项目在财政预算4800万英镑之内提前完成设定目标,共解析出386个人类及寄生物蛋白的结构。爱德华兹在SGC一期中领导一项为时3年、耗资6800万美元的计划:绘制350种人类健康相关蛋白的三维原子结构。该计划突出之处在于其规模大、研究对象具有挑战性,计划将重点放到可能用于从癌症到神经疾病和传染病等广泛人类疾病的药物治疗的蛋白上。这一项目也是目前结构基因组学这个热门领域的最大一个投资。SGC二期项目,解析另外670个重要的疾病相关的蛋白质,包括一些操作难度较高的膜蛋白,总投资超过5000万英镑。

      此外,爱德华兹领导的研究小组,在加拿大健康研究院(Canadian Institute of Health Research, CIHR)的资助下,已经辨认出18种基因,这些基因可以预测出人体对C 型肝炎的治疗是否会呈现出反应。 研究的结果将使得C 型肝炎的治疗效果更佳,并可鼓励对C 型肝炎治疗呈现出反应的病人开始或继续接受C 型肝炎的治疗。

爱德华兹已发表120多篇学术论文,多篇Nature与Cell论文,其余大都在《自然-方法学》、《自然-化学生物学》、《生物化学》等影响因子在15以上的刊物上。爱德华兹自己阐述从事科学研究的宗旨(Mission)是“To have fun and make a difference. ”(为得到乐趣,并有所作为)这句格言,对儿子的科学生涯很大.

        毕业论文结束时,儿子没有达到预期的成果.实在做不出来,导师只好放弃了,但是,儿子毕业论文还是得到优秀的成绩.后来,儿子申请博士项目中,爱德华兹教授在推荐信中给予了很高的评价,为儿子最后拿下美国医学院排名前三的三所大学,提供了强有力的支持。不过,儿子损失了七八两个月的房租!六月份完成毕业典礼,返回故乡了。

         自古以来中国就有“名师出高徒”的师承传统,在现代科学研究事业中,这种现象仍然普遍存在。早在1977年,美国哥伦比亚大学朱克曼(H.Zuckerman)在其博士论文基础上完成的成名作《科学界的精英》中指出,美国诺贝尔奖获得者选择名校接受第一流的教育是他们进入科学超级英才行列的自觉努力。朱克曼将由选择名校、选择名专业和选择名师缔结的师徒关系称为“科学行业的学徒教育”(哈里特·朱克曼著:《科学界的精英》,北京:商务印书馆,1993.  146—156.)。优秀的科学家大都出自于名师之门,“名师出高徒”的事实不断地被得到证实。著名的美国科普作家卡尼格尔( Robert Kanigel )在其《师从天才-一个科学王朝的崛起》(《 Apprentice to Genius: The Making of a Scientific Dynasty 》)一书更直接指出:“一个科学家的早期声誉,几乎一半取决于他在谁的实验室工作过--他是谁的科学后代,另一半则取决于他本人的科研发现。” 这就是科学精英成长的优势积累模式。

       本文较多地讨论毕业论文的指导教师,试图探讨一下这种优势应当如何自觉地积累起来,成为未来科研事业发展的起点资源。






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