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单分子磁镊旋转操控和基因转录调控动力学 | 《物理学报》特邀综述

已有 361 次阅读 2023-11-27 22:19 |系统分类:论文交流

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文章信息

单分子磁镊旋转操控和基因转录调控动力学

Rotation manipulation of single-molecule magnetic trapping and gene transcription regulation dynamics

张志鹏,刘帅,张玉琼,熊影,韩伟静,陈同生,王爽

物理学报, 2023, 72(21):218701.

doi: 10.7498/aps.72.20231089

原文链接    PDF


文章导读

生物物理学是一个不断发展的交叉学科,利用物理学的方法研究生命物质各层次结构与功能的关系,揭示生命现象的物理规律。然而,生命现象是大量生物分子共同作用的结果,而传统的系综实验着眼于大量分子的体系,只能提供大量分子的统计平均的结果,无法解锁生物分子的个体特征,力学性质以及它们相互作用等问题。并且,微观热涨落显著影响生物分子的运动和结构特征,导致难以捕捉这方面的信息。单分子技术的发明和发展巧妙的解决了这个问题,这类方法借助微球或荧光探针等为媒介,来观测生物分子的微观运动和结构变化,为生物学研究提供了更加丰富和本质的反应细节,提供生命活动的中间态过程以及动力学信息等,更加深刻理解生物分子的结构和功能之间的关系,阐述生物分子能量与运动信息规律,很大程度地推动了对生物物理研究的发展。


单分子操纵技术是上世纪90年代以来发展起来的,包括:光镊,原子力显微镜,磁镊等。磁镊借助磁性微球为媒介,实现对单个生物分子或细胞样品的力学性和生物学功能的研究,具有高测量通量,纳米甚至亚纳米测量精度,以及长时间尺度测量且无损伤无接触等优势,其所提供的拉力从0.1—100pN可调。近些年来,磁镊在生物大分子功能和机制方面的应用更加广泛,通过操控磁性微球,并观察和分析其运动轨迹,来研究蛋白质机器与DNA分子之间的相互作用机制,例如:RNA聚合酶转录研究、解旋酶与G-四聚体DNA结合解旋研究等。


该综述详细介绍了磁镊的工作原理,重点介绍了磁镊的旋转操控DNA分子的技术原理,解释了其具备高测量精度的本质,并进一步介绍了该技术在基因转录调控动力学研究中的重要应用,为理解磁镊如何解决科学问题提供研究范例,最后介绍了磁镊和单分子荧光成像联用的方法,该方法有望解决更加复杂的生物学问题,对未来磁镊技术在生物学的应用提出了新的展望。

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单分子磁镊旋转操控方法研究转录动力学   (a) 研究方法示意图;(b) 典型转录曲线(起始(RPitc)、延伸(RDe)和终止)


作者简介


王爽

中国科学院物理研究所副研究员

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2008年于吉林大学获得材料物理学士学位,2014年于中国科学院物理研究所获得凝聚态物理博士学位。2015年至2019年在法国法国雅克莫诺研究所(Institut Jacques Monod)和巴黎高等师范学院(Ecole Normale Superieure)从事博士后研究。目前主要研究方向是基因转录调控的单分子动力学,相关研究成果发表在Nat. Commun.Proc. Natl. Acad. Sci. USANucleic Acids Res.等期刊。主持国家自然科学基金项目2项,中国科学院青年创新促进会员项目1项。

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