[转载]DnaSP(基因多态性分析软件) 2022-09-21

DnaSP(基因多态性分析软件)是一款专业的DNA比对分析软件，多用于分析核苷酸多态性。属于生物、医学领域。DnaSP可通过合并估计，分析置信区间,输入比对后的DNA序 ...

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[转载]群体结构图形——structure堆叠图 2022-04-02

1、structure图的由来 图1 假设群体亚群数等于3（k=3）的情况下的structure分析结果 “Structure图”名词本身来自这种图形的分析软件——STRUCTURE ...

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无权查看

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基于Mash进行宏基因组数据相似性比较 2020-09-05

1、Mash软件安装 采用sourmash软件进行Mash距离计算，安装采用conda平台，如下： conda install -c bioconda sourmash 安装过程可能会失败 ...

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[转载]TBtools修饰motif结构图 2020-08-22

如果感觉MEME自动生成的motif结构图不够美观，还有用TBtools进一步对其进行美化。 1. 首先需要下载MEME生成的MEME.XML文件或者MAST.XML文件。 2. ...

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[转载]MEME在线网站查找motif步骤 2020-08-22

一、序列处理 将所获得的序列在NCBI网站上进行ORF预测（网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/），然后选定目标ORF区并下载相应的蛋白序列，具体 ...

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[转载]在线做LEfSe分析 2020-08-20

LEfSe分析，可以分析组间菌群差异，可以找出各组间特异的主要菌群，有助于开发biomaker等研究。其实我们自己也可以进行Lefse分析，只需要按照要求整理好相应的 ...

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