heatmap热图绘制教程

林国鹏 2021-1-10 15:12

heatmap.csv #教程借鉴于 R包pheatmap：用参数一步步详细绘制热图 – 我的工作墙 (gzxuexi.xyz) #第一步：公众路径设置，调用包pheatmap,读取目的文件，查看文件。 rm(list=ls()) #setwd() #getwd() library(pheatmap) library(ggplot2) data - read.csv(heatmap.csv,header=T,row.names=1) ...

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差异分析完整解决方案：Easystat

林国鹏 2020-12-28 19:26

#差异分析完整解决方案：Easystat #参考 https://cloud.tencent.com/developer/article/1655550 学习进行个人整理 data_wt.csv library(devtools) remotes::install_github(taowenmicro/EasyStat) remotes::install_git(https://gitee.com/wentaomicro/EasyStat) # 导入差异分析 ...

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聚类分析

林国鹏 2020-12-26 16:52

聚类分析 LGP 2020/12/5 #聚类分析#使用k-means聚类所需的包：#factoextra#cluster#使用内置的R数据集USArrests#install.packages(factoextra)library(factoextra) ##Loadingrequiredpackage:ggplot2 ##Welcome!Wanttolearnmore?Seetwo&nbs ...

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R语言计算spearman相关性

林国鹏 2020-10-3 20:36

install.packages(psych) library(psych) all=read.csv(1.csv) abc - corr.test(data.frame(all),method=spearman,adjust=none) write.table(t(abc$r),spearmanr.txt,sep=\t) write.table(t(abc$p),spearmanp.txt,sep=\t) bcd - corr.test(data.fram ...

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