一个物理学家和癌症研究的博客站

热度 1 周旭 2012-9-11 13:49

美国加州面临财政危机，美国九大物理研究中心之一的生物物理研究中心的掌舵人Herbert Levine离开加州圣地亚哥，赶赴富得流油（流油得富）的特克萨斯州的Rice University就职。他对癌症的看法，特别是Metastasis, 还是很深刻的。 http://physicsandcancer.org/ Creating the Field of the “Physics of Canc ...

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单细胞高精度基因表达测量的新工具:QuantiGene from Affymetrix

热度 1 周旭 2012-6-26 06:54

癌细胞往往被认为第一个具有足够致癌突变细胞的后裔。但是即使同一处的肿瘤细胞也往往类型和功能各异。目前癌症干细胞的发现使得癌细胞个个不同的异质性尤为重要。所以如果能够从单细胞层面测量不同的基因表达，将对癌 细胞的抗药性、扩散和复发的研究非常有用。以全基因组见长的Affymetrix最近推出了单细胞高精度基 ...

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适合大规模数据显示的幻灯片制作工具：Prezi

热度 2 周旭 2012-6-22 14:14

生物数理模型往往涉及到大规模的数据显示，比如全基因组变异功能分析，全RNA基因表达组分析等等。 我们往往需要及显示数据的全貌，又能够放大显示其中的细节。Prezi是这一领域非常酷的一款工具。具体可以看看我制作的一个例子： http://prezi.com/moyigbdaqzve/bcdiff_1812x65_quantilenorm_filterallcolumepless ...

个人分类: 生物物理-biophysics|4949 次阅读|2 个评论 热度 2

打游击战的癌细胞

热度 1 周旭 2012-5-5 02:27

大部分癌症病人不是死于癌症本身，而是死于癌症扩散。Fred Hutchinson癌症研究中心的研究者们发现，进入骨髓的前列腺癌细胞有的会大量增长从而导致癌细胞扩散，有些却不会如此。他们试图用单细胞的全基因表达组来寻找区分这两类细胞的"生物标记基因“。更有意义的是，这两类细胞在特定条件下可以相互转化。如何控制两类细胞 ...

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Theory Lunch: 癌细胞的干细胞与非干细胞转化模型

热度 1 周旭 2012-4-16 14:05

Cancer stem cell hypothesis triggered a bigenthusiasm for developing drugs specially targetingCancer stem cell. There are even several bioTech companies which specialized on drugs on Cancer stem cell. Unfortunately, Weinberg's group find that non-stem cancer cell can&n ...

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拿诺奖的入门指南

周旭 2012-4-9 02:25

正在读Peter Doherty一本很有趣的书《The beginner's Guide to winning the Nobel Prize: A life in Science》。 虽然Peter凭着T细胞的免疫机理拿了1996年生物诺奖， 但是这当然是彻头彻尾的标题党，实际上是他科研生涯的自传。Peter出生于澳洲，而事业成就与美利坚。他的叙事有些零零碎碎，但对如何在生物领域从事研究有 ...

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百年历史的AACR会议

热度 1 周旭 2012-4-5 23:56

具有百年历史的AACR会议(103th)，是全球癌症研究的风向标。人们发现癌症不仅仅是基因突变以后细胞的恶性增长，而且有可适应可变化的动态机制。癌症研究从寻找致癌基因向寻找致癌的细胞机制转移，所以今年AACR会议的主题就是“Epigenetics and Cancer”，这也是 如今 Cancer systems biology悄然兴起的原因. ...

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癌症干细胞概念的奠基人John Dick的新思路

周旭 2012-4-3 14:20

在多伦多的会上，癌症干细胞概念的奠基人John Dick现在试图综合癌变基因和癌症干细胞两方面的影响。他提出，部分癌变基因会使癌症有一个清晰的干细胞和分化细胞的结构，而其他癌变基因会使癌症干细胞和分化细胞相互转化。这个情况也会因不同癌症类型的不同而不同。

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