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未分类| 生活点滴| 生活点滴| Journal club| Evolution, Ecology and Genetics| R and Statistics|

设置row.names = FALSE，当你在Ｒ中写出数据时: 毛建丰 2010-7-23 15:03; 在Ｒ中写出数据时，一般通过write.table(utils)，它的用法很灵活，还有变异写法，如： write.table(x,file="",append=FALSE,quote=TRUE,sep="", eol=& ...; 个人分类: R and Statistics|18048 次阅读|没有评论

Cheat sheets & quick reference for R: 毛建丰 2010-7-22 21:54; Cheatsheets&quickreferenceforR： http://devcheatsheet.com/tag/r/?page=1 更多有用的cheatsheets请看： http://devcheatsheet.com/; 个人分类: R and Statistics|2585 次阅读|没有评论

nine "mark-up" languages that can be used to "Sweave" together data, code, and r: 毛建丰 2010-7-21 19:28; 九种mark-up languages that can be used to Sweave together data, code, and results： * LaTeX: The Sweave utility in base R provides a method for creating LaTeX files wich can then be converted to PDF files. * HTML: The R2HTML, HTMLutils, hwriter, prettyR, and Hmisc packages p ...; 个人分类: R and Statistics|2746 次阅读|没有评论

Sweave 的中文解释: 毛建丰 2010-7-21 19:23; 一直只是把sweave当成一个Ｒ函数。没想过要去用中文解释它。下面看一个wiki中文的解释。 Sweave Sweave是R语言的一个函数，其功能是将R的函数整合进Latex或Lyx中。从而可以生成动态报表，当数据或分析改变时，报表能自动得到更新。; 个人分类: R and Statistics|3362 次阅读|没有评论

一个不错的统计学资源站点，有Ｒ的内容: 毛建丰 2010-7-21 11:29; http://www.ats.ucla.edu/stat/ http://www.ats.ucla.edu/stat/r/ http://www.ats.ucla.edu/stat/r/faq/default.htm 简单，但精彩。自己看吧。; 个人分类: R and Statistics|3276 次阅读|1 个评论

R中如何把一个大的dataframe划分成小的dataframe: 毛建丰 2010-7-21 09:50; 办法其实很多。重要的是那个更适合你，对你更方便。举两个方案： 1.R中base包的方案; 一般情况下我们是要依据一个factor变量把dataframe划分。这时遇到一个问题，subset(base)可以把数据划分，但对一个subsetdataframe来说，它保留了来自原dataframe的factor变量中已经被丢弃的levels。这会给 ...; 个人分类: R and Statistics|9207 次阅读|没有评论

记着用 ddply(plyr): 毛建丰 2010-7-21 09:12; 想dataframe中对一个分组变量（因子或类似变量），应用一个种计算并且把返回值存在一个dataframe中吗？ddply(plyr) 能帮你实现。另外，plyr包中还有各种有用的funtion。几个例子： ddply(baseball, .(year), nrow) ddply(baseball, .(lg), c(nrow, ncol)) mean_rbi - function(df) mean(df$rbi, ...; 个人分类: R and Statistics|8714 次阅读|没有评论

记着用 lapply(base): 毛建丰 2010-7-21 08:50; 在R里做循环操作，似乎可以放弃for这样的循环语句。lapply(base)应该是首选途径。事实上lapply(base)是个家族。让我们看看它们的成员与用法： Description(描述) lapply returnsalistofthesamelengthasX,eachelement ...; 个人分类: R and Statistics|5516 次阅读|1 个评论

强大的，做permutation test的R包 - perm: 毛建丰 2010-7-20 17:36; 花了不少时间写permutation test组间差异显著性进行检验。后来，才发现了perm package，其中的perm() 功能实在很强大，想在自己研究中应用permutation 来做两组或多组间比较的人，不要忘了这个包。另外，它还有trend permutation tests功能。 perm & ...; 个人分类: R and Statistics|10027 次阅读|没有评论

Retrospective Power Analysis: 毛建丰 2010-7-19 08:14; 这是另一篇，关于power analysis 和 effect size的文献。事实上，类似的文献似乎也不是没有。只是主流的研究中都不提这些。 Retrospective Power Analysis, conservation biology, (2002),11:276-280; 个人分类: R and Statistics|3331 次阅读|没有评论

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