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2011年7月18日,来自哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院李霞教授课题组在《Molecular Cancer Therapeutics》杂志在线发表题为“Prioritizing candidate disease miRNAs by topological features in the miRNA-target dysregulated network: case study of prostate cancer”的文章,该文章提出了基于miRNA-靶基因失调网络优化复杂疾病miRNA的新方法,从一个全新的角度阐述了microRNA的调控机制,并为复杂疾病的机理探究、预防、诊断和治疗的发展起到积极的推动作用。
miRNA的研究已经成为分子肿瘤学领域的热点,虽然之前的差异表达分析方法已经识别了一些疾病miRNA,但是大部分miRNA在疾病中的作用还是未知的。鉴于此,该研究基于计算系统生物学的方法,从网络分析的角度开发了识别复杂疾病中miRNA的新方法。在该工作中,研究者首先结合配对的miRNA和mRNA的表达谱以及miRNA-mRNA的靶关系构建了miRNA-靶基因失调网络(MTDN),分析发现已知的疾病miRNA在网络中具有显著不同于非疾病miRNA的拓扑性质;然后依据这些拓扑以及模块化的性质对网络中的miRNA进行了优化,同时也发现相同家族或者不同家族的miRNA以协同调控的方式参与疾病;最后利用转染实验证实了三个miRNA的靶关系。该方法不仅能有效的识别疾病miRNA,而且也从系统的水平对疾病miRNA的作用机制进行了阐述。
该工作主要由已毕业博士生徐娟完成。
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GMT+8, 2024-5-28 13:56
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