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动物实验设计软件横空出世 精选

已有 10271 次阅读 2016-3-1 16:03 |个人分类:研究生培养|系统分类:海外观察|关键词:学者

 动物实验设计涉及到许多疾病规范,许多动物实验研究由于设计不合理而造成失败,有人建立一网络工具,可以让科学家免费使用评估和预测动物实验的合理性。

https://eda.nc3rs.org.uk/guide-process 

最近几年,科学家发现动物实验设计和研究结果发表方面存在许多缺陷,这些缺陷会导致研究偏差。为克服这一缺陷,许多学术期刊同意动物实验自愿报告指南,包括统计方法的选择等核对单。但是这些核对过程是在实验研究完成后进行,虽然可以提高杂志稿件质量,但对减少动物实验缺陷并没有帮助。英国国家实验动物置换,细化和减少中心NC3Rs Nathalie Percie duSert说,她希望科学家能在实验设计阶段能认真考虑这些问题。Percie du Sert的解决方案是利用一种实验设计辅助EDA软件。她希望这一2015年上线的EDA系统将能帮助提高动物实验质量,甚至可能成为动物实验研究的基本过程。

EDA系统允许科学家创建一个表示实验的可视化元素,分别表示假说、实验方法、分析方法,并用不同色彩进行逻辑连接。利用软件内置的规则发现潜在的设计问题,提出修改建议。这些可能是简单问题如没有进行随机分组,或比较复杂的潜在混杂变量控制和试验分组。这一方法可以协助科学家计算达到统计学差异需要的动物数或随机分组方法。Percie du Sert说,从基本道理上,EDA没有特别的新意。这套系统是利用好的实验设计统一的标准,也可以对年轻的刚入门的科学家进行实验设计训练。

EDA上线后,大约400个注册用户使用过这一系统,每月有50-100个动物实验设计流程图。Percie du Sert不会公开用户的详细信息,一些相关数据和使用者都需要严格保密。

WellcomeTrust桑格研究所基因组研究中心最近有一个内部培训课程,其内容就包括如何使用EDA进行动物实验设计。中心生物统计学家Natasha Karp说,研究所鼓励科学家员工使用这个软件给伦理委员会展示实验设计。她参与建立该系统并对使用情况进行了监督,也使用这一系统管理她支持的实验。

EDA不仅是一个提高动物实验研究质量和可重复性的软件系统,也有协助进行稿件检查和修改文件格式的功能。这种功能类似另外一个软件系统WebCONSORT,后者主要是用于提高临床研究报告质量的系统,而且不是免费的。卡迪夫大学科学家也有一个实验设计免费软件Protocol Navigator可以使用。EDA的特定目标是动物实验,能帮助科学家对动物实验进行快速设计和分析。

Perciedu Sert希望这种实验的直观表示能成为规范,用于研究论文和实验室结果汇报中。EDA也可以对实验设计图标注时间版本的水印标记,作为实验曾经被设计和分析的证据。这可以有效避免发生HARKing ('hypothesizingafter the results are known') 设定研究假设现象。

加拿大麦吉尔大学疼痛研究者Jeffrey Mogil说,不过这个在线系统有点小复杂,但是科学家们会逐渐习惯使用这个系统,这将是研究生进行动物实验培训的理想工具。



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