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脂肪酸分析tip 2:PLFA 16:1ω5 不宜作为土壤中菌根真菌的标志物

已有 744 次阅读 2022-8-21 17:28 |系统分类:科研笔记

存在的问题:

磷脂脂肪酸(PLFA16:1ω5经常被用作生态系统中菌根真菌(Arbuscular mycorrhiza fungi, AMF)的生化标志物,但多数情况下并不满足PLFA 16:1ω5表征AMF的先决条件。因为细菌也是PLFA 16:1ω5的重要来源,所以,只有在细菌所占比例极少的情景下(例如在植物根的内部),PLFA 16:1ω5才可能有效表征AMFFrostegård et al., 2011)。

推荐的做法:

利用中性脂肪酸(NLFA 16:1ω5可以很好地表征AMF的生物量变化(Ngosong et al., 2012)。因为NLFA通常可作为真核生物(如土壤动物、真菌等)的能量储备,由此可极大地消除细菌(原核生物)所含脂肪酸带来的“噪音”;NLFA在土壤动物食性和土壤食物网的能流特征等研究中也有重要的应用,后面再专门阐释。

 参考文献:

  •  Christopher Ngosong, Elke Gabriel, Liliane Ruess. 2012. Use of the Signature Fatty Acid 16:1ω5 as a Tool to Determine the Distribution of Arbuscular Mycorrhizal Fungi in Soil. Journal of Lipids, 2012: 2368072. https://doi.org/10.1155/2012/236807

  •  Åsa Frostegård, AndersTunlid, Erland Bååth. 2011. Use and misuse of PLFA measurements in soils. Soil Biology and Biochemistry, 43: 1621-1625.


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