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脂肪酸分析-tip 3:再谈PLFA 16:0不宜作为细菌的生化标志物

已有 677 次阅读 2022-8-27 10:01 |系统分类:科研笔记

不少纯培养的细菌菌株中PLFA 16:0的含量远高于其他脂肪酸分子,其所占比例可高达30%(刘波,2011),这可能是将PLFA 16:0作为细菌标志物的重要基础。然而,PLFA 16:0的确亦可来源于其他生物类群;例如PLFA 16:0含量在细菌的PLFAs中所占比例也可能<1%,而其在真菌PLFAs中所占比例亦可达25%(Zelles, 1997),故将PLFA 16:0作为细菌的标志物仍然是不合适的。类似地,将18:0等直链饱和脂肪酸作为细菌(General bacteria)的标志物也值得商榷,后面再专门讨论。

感谢周通在公众号Listenlii发表的文章“了解磷脂脂肪酸分析(PLFA):从Nature Microbiology到1959年原始文献”所列出的重要资料,其中福建省农业科学院刘波老师领衔撰写的专著《微生物脂肪酸生态学》给出了4000多菌株的脂肪酸组成和含量的信息,十分珍贵。

参考文献

o   刘波微生物脂肪酸生态学.中国农业科学技术出版社,2011, ISBN9787511603609.

o   Zelles, L. (1997). Phospholipid fatty acid profiles in selected members of soil microbial communities. Chemosphere 35, 275–294.

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