日本B型脑炎，在中国简称乙脑，其它地方简称日本脑炎，是由蚊子传播的一种病毒性疾病。日本脑炎在东南亚及远东地区广为流行，在1924年日本大流行时，引起4000多人的死亡，病死率高达60%以上，日本把美国拖入太平洋战争后日本脑炎令美国军方大为头痛，把研发相关疫苗作为重要任务，但还是日本首先开发出了JE-VAX，成为国际通用疫苗，中国在90年代使用新一代细胞培养灭活疫苗，1998年改为减毒活疫苗，相对比JE-VAX更便宜（成本只有1/6），但由于使用了地鼠肾细胞（PHK）作为培养载体，不为世界卫生组织及其它发达国家认可，但中国的减毒活疫苗由于成本低，免疫效果不比JE-VAX差甚至更强，不良反应更少，已为临近的印度、尼泊尔、斯里兰卡、及朝鲜等国采用。不过近年来中国某些地区也逐渐弃用减毒活疫苗而采用灭活疫苗。

中国在2008年共报告发生2975例日本脑炎，高发地区主要集中在内陆的重庆、四川、云南、与贵州一带，发生率为百万分之7-10，病死率全国平均5%。在中国的免疫计划中，乙脑属于省级地方项目，只在高发地区才强制或者推荐接种。日本脑炎疫苗预防效果50-80%，故而需要多次接种。

鼠脑疫苗的短期不良反应可以高达30%，主要是发热、不适、皮疹、易燥、呕吐、腹泄等，此外可能发生严重的荨麻疹、水肿、呼吸困难、甚至弥散性脑脊髓炎，估计发生几率万分之1左右。与鼠脑疫苗相比，新一代疫苗严重不良反应显著减少，即使是短期轻微副作用也甚少，不少研究认为低于1%或者更少。

中国建议在8月龄接种两次灭活疫苗（间隔7-10天），或者一次减毒疫苗，然后在1岁半到2岁期间加强接种一次，6岁时再接种一次。台湾采用的是15月龄接种第一次，两周后接种第二次，2岁3个月接种第三次。

日本脑炎主要由蚊子传播，人类宿主是一过性的，家畜与家禽构成病毒库，其流行特征表明疫苗在阻止其流行与传播上不占主要作用，卫生条件改善与居住环境的改善起主要作用。日本脑炎疫苗的风险与成本针对城区居民超过其效益，城区居民不推荐接种，非流行区域不推荐接种，农村及流行地区有限推荐。



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