周苑分享 http://blog.sciencenet.cn/u/yaoqizhou 论春语秋,谈科说学,声传言教。


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菠菜、天花板与诺贝尔奖:Karplus教授的科学传奇 2024-02-01
导读:去年夏天我去波士顿访问时,拜访了我的博士后导师 Martin Karplus教授。他问我知不知道他的自传《天花板上的菠菜》(Spinach on the Ceiling),我以为 ...
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RNA语言模型也来了! 2023-11-10
最近语言模型ChatGPT在回答各类问题的范围、深度和准确度上的革命性进展,掀起了开发通用大语言模型的热潮。与此同时,这些语言模型在生物高分子蛋白质上 ...
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万圣节露面的AlphaFold3,是trick还是treat(是给糖还是捣蛋)? 2023-11-02
每年10月31日是西方的万圣节(Halloween),小朋友都喜欢在这个节日里打扮成各种各样的妖魔鬼怪,去邻居家门口大喊:“trick or treat (给糖还是捣蛋 ...
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[转载]3=1+2:分割是如何攻克蛋白质结构预测的?下一步将走向何方? 2023-10-19
导读:近日,深圳湾实验室周耀旗课题组在 National Science Review 上发表综述展望: “3=1+2: How the Divide Conquered de Novo Protein Structure Pr ...
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博士职业和人生规划:与周耀旗教授的座谈录(下) 2023-04-16
本文为深圳湾实验室博士后联谊会每月例会的主题分享内容,会议全程主要使用英语交流, 周耀旗老师首先围绕主题讲了半小时, 然后大家自由提问了问一个多小时 ...
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博士的职业和人生规划:与周耀旗教授的座谈录(中) 2023-04-15
本文为深圳湾实验室博士后联谊会每月例会的主题分享内容,会议全程主要使用英语交流, 周耀旗老师首先围绕主题讲了半小时, 然后大家自由提问了问一个多小时 ...
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博士的职业和人生规划:与周耀旗教授的座谈录(上) 2023-04-11
本文为深圳湾实验室博士后联谊会每月例会的主题分享内容,会议全程主要使用英语交流, 周耀旗老师首先围绕主题讲了半小时, 然后大家自由提问了问一 ...
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ChatGPT来了,到底来了什么?科学家该怎么办? 2023-02-12
        ChatGPT 的出现,似乎颠覆了机器人回答各类问题的范围、深度和准确度,在 2 个月内用户达 1 亿,打破了抖音 ...
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韩国印象 2023-02-03
        韩国我去过了两次,不过两次都是去开会,一切行程都是会议主办方负责,匆匆忙忙地去,匆匆忙忙地离开,没有留下什么深刻的印象。 ...
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人在“羊”途 2022-12-18
导读:没想到疫情控制一放松,我就成为第一批先阳起来的人。人在“羊”途,人生又一次新的体验... AI画的两幅画:人在🐑途。 背景 ...
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cjj1234 2021-9-10 22:58
周老师您好,我是华侨大学的一名学生,我最近再看您的这篇文章 RNA secondary structure prediction using an ensemble of two-dimensional deep neural networks and transfer learning ,尝试运行了 SPOT-RNA,生成的RNA结构预测图,有些碱基对的连线是绿色的,我不太清除这个绿色的连线是怎么来的,怎么通过用VARNA的命令行画出来的呢 ,特意来请教您。 我在utils.py 这个文件中看到了 用VARNA生成结构图的代码 subprocess.Popen( , stderr=subprocess.STDOUT, stdout=subprocess.PIPE).communicate() 里面这那个tertiary_b ... ...
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