由于云南省自然生态环境多样性和脆弱性特点，资源型粗放经营的经济增长模式还没有实现根本转变，随着城市化进程的加快、人口的不断增加，自然资源开发的力度不断加大，以植被破坏、资源不合理利用、水土流失、水质污染等为代表的环境问题仍很突出，从总体上看，我省的环境形势依然严峻。

     （一）、森林生态功能衰退，草地退化严重

     ——森林面积虽有增加，但林分质量不高。森林资源分布不均，西多东少，造成许多生态问题。在河谷地带及湖泊面山，经济活动频繁，森林覆盖率较低，不足以发挥其维持生态良性循环的功能，影响了社会经济的可持续发展。

     ——草地退化严重。全省83.45万公顷的草地出现不同程度的退化，其中中度以上退化的占48.7%，而人工草地及改良草地速度缓慢，赶不上天然草场退化的速度，人工草地仅占总草地面积的1.3%。

     （二）、毁林开荒、过度垦殖的现象仍然存在

     ——人地矛盾日趋突出。我省山地占土地总面积的94%，人居适宜环境范围小，人均耕地少，人口与环境、资源的矛盾极为尖锐。

     ——陡坡地耕作面广量大，治理困难。在全省9632万亩耕地（土地详查数）中，大于25度的有1121.33万亩，占11.65%，一些地州50%的耕地坡度都在25度以上。

     （三）、生物多样性保护形势依然严峻

     ——自然保护区面积和数量不能满足生物多样性保护的需要。云南省是我国生物多样性最丰富的省份，尽管我省自然保护区个数已列全国各省区市的第一位，但自然保护区面积小，仅占全省面积的6.94%，与我省丰富的生物多样性还不相称。

     ——自然保护区基础设施建设严重滞后。云南省虽然建立了相当数量的自然保护区，但除了少数国家级和部份省级保护区有过基础设施建设投入外，其他保护区则几乎没有基建投资。有的保护区即使有过投入，也因为投资规模小，建设标准低，建设年代久，年久失修等原因，已不能满足保护管理工作需要。由于没有投入，另外还有不少保护区处于批而未建、建而不管、管而不力的状况。

     ——珍稀野生动植物面临威胁。由于珍稀野生动植物栖息环境受到生态破坏的影响，许多野生动植物的适宜生境范围越来越小，并受到“岛屿化”、“生境破碎化”的影响。野生动物肇事补偿费严重不足，赔偿问题得不到解决，挫伤了群众保护野生动物的积极性。

     （四）、农村生态环境污染日趋突出

     ——农村环境污染日益严重。由于乡镇企业、畜禽养殖业的迅速发展，农药、化肥、农用薄膜的不合理使用，在一定程度上造成了农村环境的污染和破坏。

     （五）、水土流失仍很严重，边治理边破坏的现象依然十分突出

     我省是全国水土流失最严重的省份之一，全省水土流失面积14.13万平方公里，占土地面积的36.9%，每年流失土壤5亿多吨，是全国年流失土壤量的十分之一，而且流失的土壤多是适宜耕作或植物生长的优质表土。

     （六）、生态环境灾害频繁

     我省是全国自然灾害最为严重的省份之一，灾害种类多、分布广、发生频率高、损失重，尤其是干旱、洪涝、地震、泥石流和滑坡等灾害十分严重。全省地质灾害点有20余万处，其中有危害7000余处。有35个县、市政府所在地、150个大中型厂矿、500多公里的铁路、3000多公里干线公路、1000余座水库和小型电站受到地质灾害的威胁。近些年，平均每年有6.7万公顷以上的农田和20余座中、小型水电站被淹埋或冲毁。因发生山体滑坡、崩塌和泥石流灾害而撤并了1个县的建制，4个县的县城易地重建。

     （七）、九大高原湖泊面临的生态环境问题严重

     ——入湖污染物不断增加，水质受到不同程序污染。1998年，排入九湖的废水量达25290.6万吨，排入湖中的化学耗氧量（COD）、总氮和总磷分别为54566.5吨、11347.7吨和1372.2吨。废水排放量和化学耗氧量排放量占全省排放总量的比例分别高达35.1%和12.9%。

     ——生态环境遭到破坏，流域生态系统退化。由于历史上对森林资源的过度砍伐，致使流域森林植被遭到破坏，目前九湖流域森林覆盖率很低，不足20%。流域林种单一，大多以针叶林为主，植被蓄水保土性能差，水土流失严重。

     ——水资源普遍短缺，湖泊调蓄能力差，供需矛盾突出。九湖均为封闭或半封闭湖泊，无过境河流，大多要依靠回归水的循环和外流域调水才能维持水量平衡。

     ——湖床淤积和湖泊沼泽化程度严重。由于长期以来大量泥沙和污染物排入湖中，加上“围湖造田”等不合理的开发活动，致使湖面缩小，湖床淤积，一些湖泊出现沼泽化趋势。

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