ssNMR

宋永顺 2018-3-22 23:22

solid state NMR ： 相比于 磁共振弥散加权成像（ DWI ）（见 http://blog.sina.com.cn/s/blog_45408fa40102x4e1.html ）， solid state 中的信号降低不是因为 diffusion ，而是因为不对称的相互作用。 考虑在一个小区域内，不同相互作用强度导致 spin 的去相位速度不同。 这需要非常近距离的不对称相互作用， ...

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Default bond parameters in VMD

宋永顺 2018-3-22 21:48

VMD 如何修改 CPK、line等representations 默认的键长？ 若 A 和 B 之间出现了不想要的键，可以分别选择 A 和 B ，建立两个单独的 Reps 。 这是最取巧的办法了。 否则需要写tcl scripts，见问题： http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/mailing_list/vmd-l/6470.html At present, VMD doe ...

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广义相对论

宋永顺 2018-3-18 20:55

很漂亮的一个简介： https://wenku.baidu.com/view/bd46294bc850ad02de8041ed.html?re=viewrec_flag=default 【原理阐释】 广义相对论（ General Relativity ）是描述物质间引力相互作用的理论。其基础由爱因斯坦于 1915 年完成。这一理论首次把引力场解释成 时空的弯曲 。 【发展 ...

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区块链

热度 1 宋永顺 2018-3-18 17:04

比较认真的入门文： http://www.wanbizu.com/baike/201610277824.html 或 公众号文章 (内还附视频哟) 【理论基础】 区块链是比特币的底层技术和基础架构，其本质是一种分布式记账系统。 在比特币系统中，节点是这么组织交易的：发生时间相近的交易会被放在一起，形成一个区块，然后每个区块按照 ...

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圆二色谱

宋永顺 2018-3-16 21:41

CD 谱实验 Circular Dichroism 简称 CD 谱，中文翻译圆二色谱。 【原理】 光是电磁波。 电磁波的偏振： 是最基本的电磁波。 而如果电场 E 的方向随时间周期性旋转，则得到圆偏振光。 左旋： 右旋： 二者可以合成线偏振光。 从量子力学的角度，左旋光和右旋光更基本： ...

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蛋白序列分析

宋永顺 2018-3-14 09:30

前提是不知道 DNA or RNA 序列，不然可以通过基因序列进行预测蛋白序列。 DNA 测序那些事儿： https://www.guokr.com/blog/767458/ 1. 通过电泳（比如 SDS-PAGE ）可以分离出比较纯的蛋白质。 2. 怎么从分离的样本里确定蛋白的氨基酸序列呢？ 简单，可以采用 N 末端或 C 末端法。 比如 C ...

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aqua ion

宋永顺 2018-3-13 10:21

人体内的金属一般是以水合离子的形式存在的。 当其与蛋白结合的时候，涉及的是水合层与氨基酸的竞争。一般氨基酸的构型也要满足合适的配位方式才能与水合层进行竞争。 为了研究氨基酸的空间构型，需要了解 各种金属离子水合层的结合方式，包括 形成配位的强度，以及第一水壳层中水的数目等。 这篇论 ...

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Cation-pi interaction

宋永顺 2018-3-12 19:13

【一图了解】 【基本原理】 目前理解的模型为加州理工学院的 Dennis Dougherty 等人发展的 Electrostatic Model 。话不多说，上图： 来自于 Dougherty group 的： http://www.its.caltech.edu/~dadgrp/research/cation-pi.pdf 【发现历史】 First evidence of interaction in the ...

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