R语言入门4：数据框元素的提取和作图

曹务强 2017-11-24 23:15

1. 数据框：提取元素 gene_exp Sample1 Sample2 Sample3 gene1 1 2.0 0.3 gene2 4 5.0 6.0 gene3 7 0.8 9.0 ...

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R语言入门1：安装R和RStudio

曹务强 2017-11-17 23:53

1. Windows安装R 在Windows系统上，安装R语言比较简单，直接从 R的官方网站 下载，按照正常的软件安装流程点下一步即可。 2. Windows安装RStudio R语言自带的工作窗口界面非常不美观，用起来也非常不方便。于是有人发明了RStudio： RStudio是R语言的一种集成开发环境，它是免费自由软件。RStudio同时有桌面版和服 ...

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生物信息软件安装3：安装预编译版本的BLAST

曹务强 2017-11-16 23:17

由于我国特殊的网络环境，有时候我们通过conda无法顺利下载和安装生信软件，我们必须还得熟悉传统的软件安装方式，以备不时之需。 传统的软件安装方式包括：安装预编译版本的软件和从源代码安装软件。由于从源代码安装软件的编译过程非常缓慢，一般情况下优先安装预编译版本。 1.从ftp下载预编译版本的BLAST安装包 ...

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生物信息学软件安装2：使用Bioconda管理生信软件

曹务强 2017-11-15 23:37

在苹果操作系统上，我们可以从App Store下载各种软件。Linux操作系统有没有一个类似于App Store的平台，可以使我们非常方便的下载各种软件，而不用考虑各种依赖包的问题呢？答案当然是肯定的，就是我们今天要介绍的Bioconda。 要介绍 Bioconda 首先得介绍一下Anaconda： Anaconda指的是一个开源的Python发行版本，而Bio ...

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