网络药理学 概论

热度 2 熊江辉 2011-1-15 09:14

现代基因组学、蛋白质组学、代谢组学等“组学”的发展，以及系统生物学视角的引入、创新的生物信息学工具的研究开发，极大地促进了对于 药物作用机制(Mechanism of Action, MOA) 的研究，并发展出一系列标志性的、创新的研究范式(paradigm)。现代化学生物学(chemical biology)的发展，积累了海量的关于小分子化合物的细 ...

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如何进行药物组合（配伍）？-基于网络药理学的途径

熊江辉 2011-1-15 09:04

为了试图建立药物组合的理论与原则，我们提出了“条件组合”的思路。即给定药物a为有效药物的前提下，如何筛选与之有最大协同增效、或减毒作用的药物b，以药物a、药物b组合效果优于单独的药物a，或单独的药物b为筛选原则。由于前述我们建立的基因网络本身就是基因之间协同作用的网络，因此可以直接用于药物组合的筛选。（ ...

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病人抱怨-基于Nature Medicine被撤销论文的临床实验

熊江辉 2011-1-12 23:12

据称有110位病人参与了基于被撤销论文的临床实验： http://www.genomeweb.com//node/959264?hq_e=elhq_m=904977hq_l=1hq_v=55b294d4b1 相关背景： 最新一期Nature Medicine撤销美国杜克大学肿瘤学家的一篇文章Genomic signatures to guide the use of chemotherapeutics。 http://www.nature.co ...

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也论Nature Medicine撤销杜克大学肿瘤学家论文-方法学角度

熊江辉 2011-1-11 14:44

最新一期Nature Medicine撤销美国杜克大学肿瘤学家的一篇文章Genomic signatures to guide the use of chemotherapeutics。 http://www.nature.com/nm/journal/v17/n1/full/nm0111-135.html 文中提到撤销的原因是We wish to retract this article because we have been unable to reproduce cert ...

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基因网络中“行政领导”比“明星”更重要

热度 1 熊江辉 2011-1-11 13:14

重读Science Signaling上近期发表的论文Rewiring of Transcriptional Regulatory Networks: Hierarchy, Rather Than Connectivity, Better Reflects the Importance of Regulators，如果将Hierarchy上的重要节点比作行政领导，将Connectivity上重要节点比作明星（有 ...

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大趋势-数据集成比数据采集需要更多的投入资源（人力、经费）

熊江辉 2011-1-10 22:13

最新一期Nature Chemical Biology发表了系列Commentary文章，其中The challenges of integrating multi-omic data sets 一文明确指出：多组学数据的集成、挖掘所需投入的资源可能高于数据的采集，这对从事计算生物学建模的学者无疑是极大地鼓励： The capabili ...

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