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生物信息3:生物信息学与计算生物学的区别

已有 18175 次阅读 2014-10-18 17:24 |系统分类:科研笔记|关键词:学者

薛宇最近提到“Shirley不区分生物信息学(Bioinformatics)和计算生物学(Computational biology

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=404304&do=blog&id=834869


薛宇和shirley这种成了名的剑客自然可以说“无招胜有招“。(你见过哪个大侠不装B吗?) 不过,我等小弟兄如果以为生物信息和计算生物没有区别恐会死的很惨。


生物信息学与计算生物学并不难区别,NIH的官方定义:NIH WORKING DEFINITION OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY

Bioinformatics: Research, development, or application of computational tools and approaches for expanding the use of biological, medical, behavioral or health data, including those to acquire, store, organize, archive, analyze, or visualize such data.

Computational Biology: The development and application of data-analytical and theoretical methods, mathematical modeling and computational simulation techniques to the study of biological, behavioral, and social systems.

http://www.zhihu.com/question/19720672

 

通俗来讲,

  • 生物信息学家们虽然号称为了解决生物问题,但其实关心的主要是信息和方法(也就是-informatics),与data联系更紧。最有代表性的杂志显然是bioinformatics。

  • 计算生物学家们纯粹是为了解决生物问题,过程中顺便开发了计算方法,所以叫(-biology),与systems联系更紧。最有代表性的杂志显然是plos computational biology。

  • 对计算生物学来说,应用(application)必不可少,而生物信息工作则不一定要包含应用。从这个意义上说,生物信息工作可以看作是计算生物学工作的一部分

随便翻翻两本杂志的文章,马上就会对两个概念有非常直观的理解。


值得一提的是,几位牛人都对”玩数据、作发现“或者说”计算生物学“的工作更加推崇。

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=404304&do=blog&id=834869

http://www.longwoodgenomics.org/2014/10/11/levels-of-bioinformatics-research/

这是非常有趣的一个现象,反映出科研工作中的一条基本评价标准”发现大于发明“。生物信息的绝大部分内容依然以发明为主,先天性的低于计算生物学中的发现性内容。类似的标准还有”纯学科大于应用“,比如纯数学大于应用数学。这方面我就不细说了。



https://m.sciencenet.cn/blog-522469-836732.html

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2 许培扬 seeker99

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