科学网—zhuchaodong的博文

朱朝东 2023-5-11 08:51

近日，南京农业大学植物保护学院昆虫学系张峰团队在期刊《 Zoological Systematics 》在线发表了题为“ Construction of a phylogenetic matrix: Scripts and guidelines for phylogenomics ”的论文。该研究构建了一套自定义脚本，用于系统发生基因组学中通用单拷贝直同源基因（ universal single-copy ortholo ...

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现生物种取样密度对物种分歧历史时间估算结果的影响

朱朝东 2023-3-17 10:55

物种分歧时间估算是生物系统学研究中的热点和难点。物种分歧时间不仅有助于估算物种分化速率和物种进化速率等重要参数，探究地质历史等因素在物种演化历史过程中的影响，还能探究生物区系的系统发生多样性等。目前比较成熟的物种分歧时间估算方法大多在贝叶斯分析框架下，基于分子钟理论，整合现生物种的分子序列和化石物 ...

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研究进展 | Proceedings B | 亚热带森林树木多路径调控捕食者多样性

热度 1 朱朝东 2022-12-21 18:13

亚热带森林树木多路径调控捕食者多样性人类活动和环境变化正在威胁着全球生物多样性，而生物多样性提供关键的生态系统功能和服务。植物多样性丧失对植食者的影响最为明显，对较高营养级存在什么影响？“天敌假说”常用于解释植物多样性和更高营养级之间的关系，认为：因为更多的异质环境提供了更稳定和丰富的猎 ...

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为未来分类学工作建立技术知识库的六个步骤

朱朝东 2022-12-17 12:16

为未来分类学工作建立技术知识库的六个步骤概要物种是基本的生物单位，但它们的发现和界定需要适当的数据和方法。为了更好地设定物种框架，我们必须优化概念，并加强落实概念所需的基础数据资源。在这里，我们提供了六个步骤，以更好地收集和协同我们对物种的认识。正 ...

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研究进展 | Journal of Ecology | 局域斑块及邻域植物多样性对植食者多样性格局的差异性影响

朱朝东 2022-12-10 16:07

研究进展 | Journal of Ecology | 局域斑块及邻域植物多样性对植食者多样性格局的差异性影响原文链接 https://doi.org/10.1111/1365-2745.14054 植物多样性能够通过影响高营养级节肢动物多样性，进而影响植物群落及生态系统功能。因此，了解营养级互作及生物多样性关系对 ...

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朱朝东研究组揭示亚热带森林植食性昆虫共现机制

热度 5 朱朝东 2021-10-30 08:51

朱朝东研究组揭示亚热带森林植食性昆虫共现机制 Phylogenetic relatedness, functional traits, and spatial scale determine herbivore co-occurrence in a subtropical forest Ming-Qiang Wang , Chuan Yan , Arong Luo , Yi Li , Douglas Chesters , ...

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祝贺罗阿蓉博士整合定年工作被Systematic Biology接收

热度 2 朱朝东 2019-5-20 10:03

物种分歧时间估算一直是生命之树（ Tree of Life ）进化历史研究中具挑战性的热点工作。分析过程通常涉及：核苷酸序列数据的系统发育分析；在重建的系统发育树的基础上，基于化石信息校准内部节点时点区间。在现有的绝大多数利用基因或基因组数据开展的工作中，来自化石或生物地质事件的外在时间校准信息多由 ...

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低覆盖度基因组测序获取系统发育组学数据

热度 2 朱朝东 2018-12-24 11:43

低覆盖度基因组测序获取系统发育组学数据 Phylogenomics from Low-coverage Whole-genome Sequencing Zhang, Feng; Nanjing Agricultural University, Department of Entomology, College of Plant Protection Ding, Yinhuan; Nanjing Agricultural University ZHU, Chao-Dong; Institut ...

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